茶组植物种间关系的cpDNA、rDNA ITS和mtDNA序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵洋

作者： 赵洋;杨培迪;成杨;刘本英;李游勇;杨阳

作者机构：

关键词： 茶树;种间关系;cpDNA;mtDNA;序列分析

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2018 年 01 期

页码： 27-33

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】DNA序列分析在物种系统进化、分类和鉴定等方面展示出了强大的生命力。【方法】本研究对来源于cpDNA、rDNA ITS和mtDNA序列的15对引物在茶组植物的5种2变种共16份资源中进行了种间关系研究。【结果】在15对引物中,来自cpDNA的6对引物有5对完成了扩增与测序,来自rDNA ITS的3对引物均未得到单一目的片度,来自mtDNA序列的6对引物中,共有4对完成了扩增与测序。对在种间存在位点差异的8对引物序列比对:序列长度最长的为390F-1326R(859 bp),最短的为orf25(446 bp);品种间变异位点最多的为rbcla-rev(24个),最少的为nad4L/orf25(2个)。位点变异率最高的为rbcla-rev(4.76%),最低为nad4L/orf25(0.37%),cpDNA的碱基变异率平均值(2.91%)要远高于mtDNA(0.55%);8对引物在茶变种内发生变异的位点共有9个,占总位点数的0.19%;不同变种间发生变异的位点有90个,占总位点数的1.85%;将8对引物测序得到的序列拼接,按照MP法构建了分子系统树,可以将参试的16份茶树资源分为3大类。【结论】本研究为DNA序列分析在茶组植物中的应用提供了参考。

分类号： S571.1

  • 相关文献

[1]基于叶绿体rbcL和trnH-psbA序列的湖南茶树资源遗传多样性与亲缘关系研究. 成杨,赵洋,杨培迪,杨阳. 2018

[2]基于nSSR和cpDNA序列的城步峒茶群体遗传多样性和结构研究. 刘振,成杨,杨培迪,赵洋,宁静,杨阳. 2020

[3]北部湾3种金线鱼属鱼类COI基因序列的比较分析. 董丽娜,黄梓荣,艾红,卢伟华,李希国,李娜娜,李夏,李永振. 2011

[4]水稻线粒体DNA中与雄性不育有关特异片段的克隆及序列分析. 杨剑波,汪秀峰,赵成松,向太和,李莉. 2002

[5]茶树糖转运蛋白CsPLt基因的克隆与序列分析. 陈玫,夏丽飞,陈林波,蒋红旗,田易萍,包云秀,尚未琼. 2014

[6]茶树生长素抑制蛋白基因CsARP1的克隆与表达分析. 王新超,马春雷,杨亚军,姚明哲,金基强. 2011

[7]茶树查尔酮异构酶基因克隆及序列分析. 马春雷,赵丽萍,张亚丽,陈亮. 2007

[8]茶树无色花色素还原酶基因克隆及表达分析. 马春雷,乔小燕,陈亮. 2010

[9]茶树CsAP2基因的全长cDNA克隆与序列分析. 方成刚,夏丽飞,陈林波,田易萍,包云秀,尚未琼. 2014

[10]茶树黄酮醇合成酶基因的克隆与原核表达. 马春雷,陈亮. 2009

[11]茶树肌动蛋白基因(CsActin1)全长cDNA克隆与生物信息学分析. 杨亚军,王新超,马春雷. 2012

[12]茶树‘紫娟’肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)克隆及序列分析. 陈林波,宋维希,李晓霞,夏丽飞,周萌,梁名志,焉文光. 2016

[13]茶树HMGS基因的克隆与序列分析. 陈林波,刘本英,汪云刚,夏丽飞,李友勇,田易萍. 2013

[14]K、V、T型小麦细胞质雄性不育系叶绿体DNA的SSR分析及RuBP羧化酶活性比较. 袁凯,张婷,史晓芳,行翠萍,李楠楠,高庆荣. 2019

[15]江华苦茶的亲缘关系与遗传多样性研究. 刘振,赵洋,杨培迪,罗军武,杨阳. 2019

[16]基于cpDNA变异对中国梨野生资源的遗传多样性研究. 詹俊宇,曹玉芬,齐丹,田路明,董星光,张莹,霍宏亮,徐家玉,刘超,张思梦,王超. 2020

[17]棉花新材料A111基于cpDNA的种性初步鉴定. 冯坤,刘方,蔡小彦,黎绍惠,周忠丽,张先亮,华金平,王坤波. 2013

[18]江华苦茶不同单株间亲缘关系的cpDNA序列分析. 刘振,杨阳,罗军武. 2017

[19]蚂蚁对草地动植物及土壤作用的研究进展. 赵一军,赵敏,毛文娅,于应文. 2019

[20]西藏黑斑原鮡消化道寄生蠕虫的分布类型及种间关系. 潘瑛子,付佩佩,王且鲁,周建设,牟振波,胡光冉. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序