垂穗披碱草MADS-box基因WM8克隆及分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张妙青
作者: 张妙青;张吉宇;刘志鹏;王彦荣;张磊
作者机构:
关键词: 垂穗披碱草;MADS-box;WM8基因;序列分析;蛋白结构
期刊名称: 草业学报
ISSN: 1004-5759
年卷期: 2012 年 21 卷 04 期
页码: 141-150
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 通过同源克隆从垂穗披碱草中获得了MADS-box基因家族WM8基因的全长cDNA序列,命名为EnWM8(Genbank登录号为JF683846)。序列分析表明,该cDNA全长1 196bp,开放阅读框共编码275个氨基酸,具有典型的MADS-box结构域以及半保守的K区,是MIKC型MADS-box基因,分析认为其与花发育和果实成熟等有关。EnWM8与小麦的WM8、AGL29和fruitful-like基因氨基酸的推导序列的相似性分别高达95.62%,96.72%和96.28%。采用DNAMAN软件进行系统进化树分析显示,EnWM8基因与小麦的TaWM8进化关系最近,与拟南芥的AtWM8、AtAGL29进化关系较远。垂穗披碱草WM8蛋白分子量为13 726.7Da,理论等电点为9.14,为亲水性的碱性蛋白,无跨膜结构域,定位于细胞核中,其空间结构主要由α-螺旋、无规则卷曲和延伸链构成。研究结果可为进一步从分子水平探明垂穗披碱草花发育、种子成熟等机制提供参考。
分类号: S543.9
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