棉花叶绿体基因RNA编辑位点的测定及分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 范术丽

作者: 范术丽;宋美珍;俞嘉宁;喻树迅

作者机构:

关键词: 叶绿体;顺式作用元件;棉花;RNA编辑

期刊名称: 植物学报

ISSN: 1674-3466

年卷期: 2011 年 46 卷 04 期

页码: 386-395

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 陆生植物叶绿体RNA编辑是转录后基因表达调控的一种重要方式。该文在预测棉花(Gossypium hirsutum)叶绿体基因RNA编辑位点的基础上,选取中棉10(CRRI 10)为实验材料,采用PCR、RT-PCR及测序等方法,确定CRRI 10的27个叶绿体蛋白编码基因共有55个编辑位点,均是C→U的转换。与棉种柯字310(C310)的编辑位点比对后发现,CRRI 10多出accD-468和rpoC1-163两个编辑位点,同时缺失psbN-10。利用生物信息学分析这3个位点,rpoC1-163和psbN-10的编辑可能会改变各自蛋白的二级结构。对CRRI 10中55个编辑位点上游的顺式作用元件(?30–?1)分析显示,共有8组顺式作用元件的相似性达到60%或以上,推测各组中的编辑位点可能由相同的反式作用因子来识别。

分类号: S562`Q943

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