基因表达分析稻瘟病菌中8个假定RhoGAP蛋白与几丁质合酶的关系

文献类型： 中文期刊

第一作者： 叶文雨

作者： 叶文雨;豆献英;陈美莲;牛晓庆;杨雪

作者机构：

关键词： 稻瘟病菌;RhoGAP;生物信息学;几丁质合酶;Real-time PCR

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2016 年 35 卷 10 期

页码： 2724-2729

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过分析稻瘟病菌Rho GAP家族基因与几丁质合酶家族基因的表达关系,研究该家族基因对细胞壁形成的影响。利用不同生物信息学软件对Rho GAP家族进行序列分析,运用RT-PCR技术获得了该家族基因的部分c DNA序列,通过实时荧光定量技术分析Rho GAP基因与几丁质合酶基因的表达关系。结果表明,稻瘟病菌数据库中8个Rho GAP基因均含有保守的GAP结构域,且为水溶性蛋白,蛋白分子量相对较大,系统进化分析结果显示,16个Rho GTP酶激活蛋白可分为两类;不同的几丁质合成酶基因在不同Rho GAP基因突变体中的表达量不同,总的趋势是上调的。说明Rho GAP基因家族蛋白可能参与了稻瘟病菌不同阶段细胞壁的合成,本结果为进一步研究Rho GAP家族基因参与多样性的代谢途径奠定了基础。

分类号： S435.111.41

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