基于40K SNP芯片的陆地棉产量构成因素全基因组关联分析及单铃重位点挖掘

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李宜谦

作者： 李宜谦;徐守振;刘萍;马麒;谢斌;陈红

作者机构：

关键词： 陆地棉;产量构成要素;全基因组关联分析;单铃重;高产育种

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2025 年 51 卷 008 期

页码： 2128-2138

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 棉花经济产量主要受单株铃数、单铃重和衣分等产量构成因素的影响,解析棉花产量构成因素的遗传机制对指导分子育种具有重要意义.本研究以 612 份陆地棉品种(系)构成的自然群体为研究材料,利用基于液相探针杂交的 40K SNP芯片进行基因型分型,并在 5 个自然环境下调查单株铃数、单铃重、衣分及籽棉产量等性状.通过全基因组关联分析共检测到 6 个显著关联位点,包括与单株铃数相关的 2 个位点(A03、A05 染色体)、与单铃重相关的 1个位点(A07 染色体)、与衣分相关的 1 个位点(D01 染色体)和与籽棉产量相关的 2 个位点(A05、D07 染色体).其中,位于A07染色体 89.01~90.45 Mb区间的QTL在 5个环境中与单铃重显著关联(P=5.3646×10-8),表现出较高的稳定性.通过单倍型分析发现该区间存在 2 个主要单倍型,携带有利单倍型的材料平均单铃重显著增加 0.64 g.结合深度重测序数据和转录组数据分析,在该区间鉴定到 7 个候选基因,并确定了可用于分子标记开发的关键 SNP位点.本研究不仅丰富了陆地棉产量性状的遗传解析结果,而且为高产育种提供了重要的分子信息.

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