苹果Ty1-copia类逆转座子家族鉴定及特性分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 孙俊

作者: 孙俊;房经贵;孙其宝;章镇

作者机构:

关键词: 苹果;Ty1-copia类逆转座子;逆转录酶;进化

期刊名称: 西北植物学报

ISSN: 1000-4025

年卷期: 2009 年 29 卷 12 期

页码: 13-17

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 根据逆转座子RT保守序列设计引物,利用PCR方法从苹果‘嘎拉’中克隆了20条RT片段,分析苹果基因组内Ty1-copia类逆转座子家族特性及进化关系。结果显示,20条逆转录酶保守序列表现出了高度的异质性。结合已报道的37条苹果Ty1-copia类逆转座子RT片段,构建了系统发育树,发现家族1、3和4中具有转座活性的逆转座子的可能性较大;序列分析表明,Ty1-copia类逆转座子是苹果基因组内序列重组的热点。用RT序列为探针进行Southern杂交,发现苹果基因组内Ty1-copia类逆转座子拷贝数高、分布广泛。研究结果为进一步分离具有转座活性的苹果Ty1-copia类逆转座子及其人工诱导芽变奠定了基础。

分类号: S642.2

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