木薯中lncRNA-CRR5在低温胁迫下的功能分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 沈婕

作者： 沈婕;董世满;李淑霞;彭明

作者机构：

关键词： 木薯;低温胁迫;lncRNA;功能分析;同源性分析;RNA二级结构预测;共表达基因分析;靶基因

期刊名称： 热带作物学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 001 期

页码： 40-46

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 低温胁迫严重影响木薯的生长、产量以及块根品质。长链非编码RNAs（lncRNAs）作为关键的调节因子,在植物响应非生物胁迫过程中发挥重要的功能。然而,lncRNAs在木薯中的功能和调控机制尚无报道。因此,为了研究木薯lncRNAs在低温胁迫应答中的功能,本研究以木薯主栽品种’60444’为材料,利用低温处理前后的叶片转录组数据,鉴定到一个受低温胁迫调控的lncRNA（cold-responsive lncRNA5,CRR5）。通过对其序列比对进行同源性分析,RNA二级结构预测和共表达分析鉴定来分析lncRNA-CRR5响应低温胁迫的分子功能。并根据基因的共表达分析推测CRR5的顺式作用和反式作用靶基因。这些结果为更进一步研究CRR5的功能提供了理论依据。

分类号： S533

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