粗山羊草Dof转录因子家族基因的鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵梦琪

作者： 赵梦琪;周正富;齐豫川;晁岳恩;王美芳;何盛莲;李文旭;秦毛毛;吴政卿;雷振生

作者机构：

关键词： 粗山羊草;Dof转录因子;基因家族;表达谱

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2017 年 07 期

页码： 2590-2597

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： Dof(DNA-binding one zinc finger)基因家族是植物特有的一类包含高度保守的C_2-C_2锌指结构域的转录因子,其在植物种子发育与萌发、光、激素以及逆境响应中起到重要调控作用。本研究基于已公布的粗山羊草基因组数据,采用生物信息学方法鉴定了粗山羊草Dof基因,并对其结构、保守结构域、染色体定位、系统进化树和表达谱进行了详细的分析。结果表明:粗山羊草Dof转录因子家族包含10个基因,它们均含有完整的C_2-C_2锌指保守结构域;每个基因含有1~3个内含子,AetDof家族蛋白共包含11个保守的模体;该家族基因除7号染色体外,在其余染色体上均有分布;与拟南芥Dof蛋白构建系统发育树发现,该家族基因可被分为3个亚族;转录组数据分析显示,粗山羊草Dof基因的表达具有组织特异性,其中3个转录因子(AetDof1,AetDof7,AetDof10)在种子中特异性强表达。本研究结果为深入解析粗山羊草Dof基因的功能提供了参考依据。

分类号： Q943.2`S512.1

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