石榴等观赏植物DFR基因生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陶吉寒

作者： 陶吉寒;冯立娟;苑兆和;招雪晴;尹燕雷

作者机构： 山东省果树研究所

关键词： 石榴;二氢黄酮醇4-还原酶(DFR);生物信息学;理化性质;跨膜结构

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2013 年 45 卷 04 期

页码： 14-17

摘要： 根据GenBank中已登录的红花石榴、粉花石榴、姜荷花、芍药、水母雪莲、大丽花、瓜叶菊和兰花等植物二氢黄酮醇4-还原酶(DFR)基因的核苷酸序列和氨基酸序列,应用生物信息学软件对其核苷酸序列的外显子、氨基酸序列的理化性质、疏水性/亲水性和跨膜结构等进行了预测。结果表明,这几种植物DFR基因均存在1个外显子,含量最丰富的氨基酸是Ala、Gly、Cys和Thr;除红花石榴和粉花石榴DFR属于不稳定蛋白外,其余植物均属于稳定蛋白。这几种植物DFR蛋白均为亲水性蛋白,存在明显的疏水区和亲水区以及跨膜结构等。

分类号： S686

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