利用130K液相芯片分析中国蚕豆种质资源遗传多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张红岩

作者： 张红岩;敏玉霞;滕长才;彭小星;陈志凯;周仙莉;娄树宝;刘玉皎

作者机构：

关键词： 液相芯片;蚕豆;遗传多样性;群体结构;遗传变异

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2024 年 008 期

页码： 1989-2000

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 全面了解我国蚕豆种质资源遗传多样性和群体结构,对优异资源的挖掘和创新利用具有重大意义。本研究利用130K液相芯片对822份中国蚕豆种质资源进行基因分型,开展遗传多样性研究。经过严格过滤,获得了30,946个高质量SNP位点,其中多态性信息量(PIC)变化范围为0.0905～0.3750,平均为0.2600; Nei’s基因多样性指数变化范围为0.0950～0.5000,平均为0.3222。基于地理来源,利用Nei’s基因多样性指数和PIC评价蚕豆资源遗传多样性,发现江苏和四川蚕豆资源的遗传多样性较为丰富;新疆蚕豆资源遗传多样性最低。群体结构分析表明, 822份蚕豆资源可被划分为2个亚群,当Q≥0.6时, 717份资源遗传背景相对比较单一;同一亚群内包含不同生态类型的材料,表明材料间发生了基因交流或渐渗现象。基于邻接法(NJ)的聚类分析和主成分分析结果表明,822份蚕豆资源同样分为2个类群,与群体结构分析结果基本一致。总体而言,地理来源邻近和生境相近的资源间的遗传关系较近,且常被归为同一类群或亚群。分子方差分析结果表明,个体间的遗传变异是总遗传变异的主要来源。

分类号： S643.6

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