绿豆bHLH转录因子家族的鉴定与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈红霖

作者： 陈红霖;胡亮亮;王丽侠;王素华;程须珍

作者机构：

关键词： 绿豆;bHLH;转录因子;生物信息学分析

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2017 年 18 卷 06 期

页码： 1159-1167

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： bHLH是真核生物中重要的一类转录因子,其主要由碱性氨基酸区和螺旋-环-螺旋区组成。本研究利用生物信息学的方法鉴定到122个绿豆bHLH转录因子,并对其理化性质、保守结构域、基因结构、在染色体上的分布、系统进化以及部分典型基因的组织表达差异等进行分析。结果表明,bHLH转录因子理化性质差异较大;含有2个保守结构域,分别位于N端的碱性氨基酸区和C端的螺旋-环-螺旋区,碱性氨基酸区含有His5-Glu9-Arg13保守序列,与靶基因结合有关,HLH区含有Arg23和Arg55,与形成二聚体有关,同时含有5种保守元件;bHLH基因在11条染色体上分布不均匀,5号、7号和8号染色体上分布较多,1号、4号和10号染色体上分布较少,大部分基因含有1~9个不等的内含子,在染色体上成簇状分布;122个bHLH转录因子可分为11个亚家族。多数bHLH基因在绿豆根、茎、叶、花和种子等组织中均有表达,但具有组织表达特异性,且不同基因表达量差异较大。本研究为进一步研究绿豆bHLH转录因子家族的生物学功能奠定基础。

分类号： Q943.2`S522

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