枇杷EjWRKY27基因克隆及低温响应表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李晓颖

作者： 李晓颖;徐红霞;葛航;陈俊伟

作者机构：

关键词： 枇杷;EjWRKY27;基因克隆;表达分析;蛋白特征分析;亚细胞定位

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2023 年 022 期

页码： 7351-7359

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： WRKY是植物中所特有的转录因子家族，参与植物形态建成及非生物胁迫响应等多种生物学过程。本研究对枇杷EjWRKY27基因进行克隆、生物信息学分析，并对其在枇杷5个发育组织及低温胁迫下的表达模式进行探究。研究结果显示，该基因位于枇杷基因组14号染色体上，编码区长度2 157 bp，编码719个氨基酸，氨基酸序列包含WRKY结构域，属于IIb亚家族成员。系统进化结果进一步显示该序列与同是蔷薇科植物包括苹果、梨、桃、樱桃、梅、杏的同源性较高。生物信息学分析结果表明，EjWRKY27蛋白不是分泌蛋白，也不含信号肽和跨膜区；该蛋白为亲水性蛋白，其分子量、等电点、脂溶指数、不稳定性指数、平均亲水性值依次为73.12 kD,6.90,54.85,56.63,-0.752;EjWRKY27有128个磷酸化位点，其中丝氨酸92个、苏氨酸30个和酪氨酸6个。Ej WRKY27蛋白的二级结构以无规卷曲为主，比例为67.45%，其次为α螺旋，比例为21.5%，而延伸链、β转角的比例仅为8.84%和2.21%。该蛋白的三级结构域主要由RVSVIVR、WRKYGQK、RAYYRC、RKQVQR、ILVTTYE共5个β-折叠组成。RT-qPCR分析表明，该基因在根和果实中特异高表达，并受低温胁迫诱导，在处理0.5 h时显著应激上调表达。亚细胞定位预测表明EjWRKY27定位在细胞核内，而烟草瞬时表达系统的验证结果也证实如此。本研究结果为进一步研究EjWRKY27在逆境胁迫下的响应机制提供了一定的理论基础。

分类号： S667.3

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