猪A组轮状病毒VP7基因的克隆及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 谷长维

作者: 谷长维;谷鸣;张玲;胡博

作者机构:

关键词: A组轮状病毒;VP7基因;克隆;生物信息学分析

期刊名称: 畜牧与饲料科学

ISSN: 1672-5190

年卷期: 2020 年 01 期

页码: 13-17

摘要: 为了研究猪A组轮状病毒VP7基因功能,根据GenBank中猪轮状病毒VP7基因DNA序列设计引物,以实验室轮状病毒上海分离株SH-1为模板,进行PCR扩增,将VP7基因克隆到pMD-18T载体后,进行序列测定及分析。结果表明:此序列编码326个氨基酸,其相对分子量为37.38 Ku,理论等电点(PI)为4.77。VP7蛋白以α螺旋为主,主要有13个抗原表位区域。系统进化树分析显示分离株SH-1与KM230930.1株亲缘关系最近,基因型分析结果是G10型,属于人兽共患病毒株。

分类号: S852.651

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