四倍体野生种花生Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的分离及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 蔡铁城

作者： 蔡铁城;张冲;刘菁;阳太亿;陈华;蒋菁;贺梁琼;韩柱强;唐荣华;庄伟建;刘俊仙;熊发前

作者机构：

关键词： 花生;Ty3-gypsy类反转录转座子;反转录酶;异质性;四倍体野生种

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 021 期

页码： 6972-6981

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究从四倍体野生种花生中分离了Ty3-gypsy类反转录转座子的反转录酶（RT）基因序列，分析了其序列特点和差异，为研究其转录活性和功能奠定基础。根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的保守区设计简并引物，PCR扩增四倍体野生种花生（Arachis monticola）（PI468199）的DNA，目的条带经回收、克隆和测序后，进行生物信息学分析。结果显示，目的条带大小约为430 bp，共有29条AmRT2-X基因序列被分离出，这些序列长度变化范围为397～433 bp,AT所占比例范围为55.66%～65.97%，核苷酸序列间相似性在45.1%～97.2%之间，存在较高异质性；29条AmRT2-X基因序列被聚类划分为8个家族，家族A是包含序列最多的家族；翻译成氨基酸后，有10条AmRT2-X基因序列发生了无义突变；氨基酸序列间相似性在22.3%～98.6%之间，呈现高度异质性；绝大部分AmRT2-X基因序列的保守基序一致；系统进化树显示，所有RT基因序列被分为6类，其中，Ⅰ类包含20条AmRT2-X基因序列，Ⅱ类中的4条Am RT2-X基因序列与来自拟南芥、多花黑麦草、火龙果、牡丹、果梅、枣、山桑、白皮松等物种的序列之间亲缘关系较近；通过比对花生EST数据库，发现2条具有转录活性的四倍体野生种花生Ty3-gypsy类反转录转座子。本研究为Ty3-gypsy类反转录转座子全长序列的分离及其功能的研究提供一定基础。

分类号： S565.2

  • 相关文献

[1]四倍体野生种花生Ty1-copia类逆转座子逆转录酶基因的克隆与分析. 阳太亿,刘俊仙,刘菁,蒋菁,韩柱强,贺梁琼,唐秀梅,钟瑞春,黄志鹏,吴海宁,唐荣华,熊发前. 2019

[2]果蔗Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的多样性分析. 刘俊仙,阳太亿,刘菁,张荣华,卢曼曼,雷敬超,高轶静,丘立杭,李松,熊发前. 2022

[3]栽培种花生Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶基因序列的分离与分析. 熊发前,刘俊仙,刘菁,阳太亿,贺梁琼,蒋菁,韩柱强,唐秀梅,钟瑞春,吴海宁,黄志鹏,唐荣华. 2022

[4]五种鲟鱼线粒体控制区异质性和系统发育分析. 王巍,朱华,胡红霞,田照辉,董颖. 2009

[5]稻褐飞属生物型的最新研究进展. 姜人春. 1999

[6]旱稻孢囊线虫在广西的发生及其rDNA-ITS异质性分析. 宋汉达,王宏洪,陶冶,张洪玲,陆秀红,黄金玲,刘志明,廖金铃. 2014

[7]海量生物数据异质性分析与整合技术. 白云峰,王立方,包文斌,陈国宏. 2008

[8]成员异质性对合作社绩效评估影响及比较分析. 王丽佳,霍学喜. 2016

[9]基于中分辨率影像的农田管理单元自动提取研究. 张竞成,顾晓鹤,王纪华,黄文江,何馨,罗菊花. 2010

[10]马铃薯晚疫病菌生理小种的异质性研究. 袁军海,姚裕琪,张爱香,孟兆军. 2001

[11]防止和修复湖泊水库富营养化渔业操纵的探讨. 王宇庭,叶金云,郑荣泉. 2017

[12]黄瓜叶片分布的异质性表型特征分析与模型建立. 钱婷婷,陆声链,郑秀国,赵京音,王剑,杨娟. 2019

[13]IR64品种内残余变异的来源和遗传模式. 吴建利,施勇烽,陈洁,Casiana VERA CRUZ,庄杰云,Hei LEUNG,郑康乐. 2007

[14]区位效应对农户耕地撂荒行为的影响及异质性研究-基于4省529户农户调查的实证分析. 李辉尚,郭昕竺,曲春红. 2020

[15]基于土壤水分异质性的小麦滴灌试验小区布设方法. 王鹏翔,宋妮,陈智芳,王峰,申孝军,王景雷. 2017

[16]基于代谢组学的芽胞杆菌属间胞外代谢物异质性研究. 陈峥,刘波,史怀,陈梅春,潘志针,朱育菁,刘国红. 2012

[17]甘蔗Ty3-gypsy类逆转座子RT基因的克隆及分析. 刘俊仙,刘菁,阳太亿,高轶静,段维兴,雷敬超,刘丽敏,刘红坚,张荣华,何为中,李松,熊发前. 2021

[18]河西走廊山地-绿洲-荒漠复合生态系统的景观异质性分析. 刘学录,任继周. 2003

[19]高等植物线粒体基因组研究进展. 张晓,张锐,侯思宇,史计,郭三堆. 2011

[20]单细胞测序技术及其在畜牧科学研究中的应用. 康彦东,王兴东,郭韶珂,曹梦丽,郭宪. 2022

作者其他论文 更多>>

微信小程序