我国苏南地区美洲鲥7个养殖群体的遗传多样性分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李玉林
作者: 李玉林;罗明坤;冯冰冰;朱文彬;傅建军;梁政远;解旭东;缪凌鸿;董在杰
作者机构:
关键词: 美洲鲥;微卫星;D-loop区;遗传多样性
期刊名称: 上海海洋大学学报
ISSN: 1674-5566
年卷期: 2024 年 002 期
页码: 285-296
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为探讨苏南地区美洲鲥养殖群体的种质资源现状及遗传多样性水平,采用15个微卫星标记和线粒体D-loop序列,对7个不同群体:镇江丹徒(Dtq)、镇江扬中(Yzq)、苏州张家港(Zjg)、苏州相城(Xcq)、南通中洋(Zyq)、常州滆湖(Ghq)和常州武进(Czq)共计210尾个体进行群体多样性分析。结果显示,15个SSR位点中除Asa-12外,其余位点均表现为高度多态性(PIC> 0.5)。其中,7个群体期望杂合度(He)为0.615~0.758,多态信息含量(PIC)为0.568~0.723,两者均以Zjg群体最高。D-loop序列共检测到32个变异位点,定义了20个单倍型,其中Zjg群体单倍型最多(11个)。7个群体的单倍型多样性、核苷酸多样性指数分别为0.618~0.945、0.003~0.008。基于SSR和D-loop序列的遗传距离分析,发现Ghq群体和Zyq群体的Nei’s遗传距离(0.058)和K2P遗传距离(0.003)最近,低于其他群体间的遗传距离(分别为0.073~0.397和0.003~0.006)。综合分析,发现7个美洲鲥群体的遗传多样性较为丰富,而群体间遗传变异程度不高,基因流Nm> 1和镶嵌式排列的个体进化树也证实7个群体的亲缘关系较近。基于本研究,可初步了解苏南地区鲥的种质现状,为后续进一步开展育种工作奠定理论基础。
分类号: S965.219
- 相关文献
[1]我国蛋用型地方鸡品种遗传多样性分析. 陆俊贤,贾晓旭,唐修君,樊艳凤,唐梦君,高玉时,苏一军. 2016
[2]4个优质鸡群体mtDNA D-loop区遗传多样性分析. 李莹,何国戈,王艳,何静怡,黄爱珍,郑经成,葛影影,罗成龙. 2020
[3]野牦牛(Bos grunniens mutus)mtDNA D-Loop区的遗传多样性. 马志杰,钟金城,韩建林,徐惊涛,窦全林,常怀普. 2009
[4]中国湛江市和哈尔滨市褐家鼠种群遗传结构及其年度变化特征. 陈燕,马晓慧,王大伟,李宁,姚丹丹,冯志勇,刘晓辉,宋英. 2021
[5]基于mtDNA D-loop区全序列的琅琊鸡遗传多样性和系统进化研究. 唐修君,贾晓旭,樊艳凤,高玉时,葛庆联,顾荣,陆俊贤,刘茵茵,王珏. 2017
[6]基于mtDNA控制区2个地方鸡品种遗传多样性及起源研究. 唐修君,贾晓旭,樊艳凤,葛庆联,唐梦君,周倩,陆俊贤,韩威,高玉时. 2021
[7]太湖鲢鱼mtDNA D-loop区遗传多样性. 王茂元,杨弘,邹芝英,李大宇,祝璟琳,肖炜. 2009
[8]鲁西黑头羊mtDNA D-loop区遗传多样性与遗传分化研究. 王金文,崔绪奎,陶卫东,储明星,张果平,王德芹,狄冉. 2016
[9]罗非鱼mtDNA D-loop区部分序列结构和种群遗传多样性分析. 吴长敬,邹芝英,杨弘,李大宇,祝璩琳,肖炜. 2010
[10]福建省家鸭的遗传多样性及其与野鸭的亲缘关系. 李慧芳,徐文娟,朱文奇,薛素美,陈宽维. 2008
[11]山东猪种mtDNA D-loop区部分序列遗传多样性及系统进化研究. 王继英,郭建凤,孙守礼,王诚,张印,武英. 2009
[12]基于mtDNA控制区遗传变异分析大骨鸡遗传多样性及系统进化. 唐修君,贾晓旭,樊艳凤,高玉时,葛庆联,唐梦君,陆俊贤,顾荣,刘茵茵. 2019
[13]大菱鲆引进群体与国内累代繁养群体线粒体D-loop区部分序列的遗传多态性分析. 刘滨,刘新富,刘思涛,孟振,张和森,刘奇,王峰,雷霁霖. 2013
[14]基于线粒体Cytb基因和D-loop区的野生与养殖小黄鱼群体遗传多样性. 郭丹丹,刘峰,牛宝龙,楼宝. 2022
[15]基于线粒体DNA D-loop区全序列分析儋州鸡遗传多样性及其起源进化关系. 李义书,侯冠彧,曹婷,施力光,周汉林,周雄. 2019
[16]长鳍鲤mtDNA D-loop区序列结构和多态性分析. 邹芝英,杨弘,罗永巨,吴长敬,李大宇,祝璟琳,肖炜. 2013
[17]基于线粒体D-loop区分析茶花鸡遗传多样性和起源进化. 范梅华,唐修君,贾晓旭,樊艳凤,葛庆联,陆俊贤,韩威,高玉时. 2019
[18]新疆引进羊驼遗传多样性与系统发育研究. 吕雪峰,邢巍婷,许艳丽,张敏,王乐. 2017
[19]鲁西黑头羊mtDNAD-loop区遗传多样性与遗传分化研究. 王金文,崔绪奎,陶卫东,储明星,张果平,王德芹,狄冉. 2016
[20]基于线粒体Cyt b基因和D-loop区序列的雅鲁藏布江中上游黑斑原鮡遗传多样性分析. 孙超,周建设,王万良,王壮壮,何昊明,户国,普布. 2024
作者其他论文 更多>>
-
鳙长江中下游群体的D-loop序列遗传分析
作者:傅建军;朱文彬;罗明坤;王兰梅;董在杰
关键词:鳙;线粒体DNA;D-loop序列;种群多样性;遗传分化
-
不同体色锦鲤自交及红白♀*福瑞鲤2号♂杂交子代的生长与形态分析
作者:郭珺;陈小玉;史秀兰;罗明坤;林凯;董在杰
关键词:锦鲤;福瑞鲤2号;生长;形态
-
不同人工孵化模式对青海湖裸鲤孵化效果的影响
作者:魏盼盼;丰朝晖;俞录贤;祁洪芳;董在杰
关键词:
-
套养池塘主要养殖阶段浮游生物的群落结构特征
作者:傅建军;安睿;朱文彬;王兰梅;罗明坤;董在杰
关键词:浮游生物;群落结构;环境因子;RDA分析
-
甜瓜CmRDR基因家族的鉴定及其对CGMMV侵染的表达分析
作者:李玉林;王玉环;姚依秀;何艳军;范敏;高杰
关键词:甜瓜;RNA依赖性RNA聚合酶(RDR);黄瓜绿斑驳花叶病毒;基因表达;进化分析
-
基于D-loop序列和微卫星标记的4个黄颡鱼群体的遗传变异分析
作者:李兵部;傅建军;陶易凡;强俊;徐跑
关键词:黄颡鱼;微卫星标记;D-loop序列;遗传多样性;群体结构
-
饲料中添加串叶松香草对团头鲂幼鱼生长性能、抗氧化能力和脂肪代谢的影响
作者:胡颂钦;林艳;史秀兰;迟长虹;严盈;缪凌鸿;董在杰
关键词:团头鲂;串叶松香草;生长性能;抗氧化能力;脂代谢