柑橘GGP基因家族生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王平

作者： 王平;柯甫志;徐建国

作者机构：

关键词： 柑橘;GGP基因家族;生物信息学分析;功能预测;基因表达

期刊名称： 浙江农业科学

ISSN： 0528-9017

年卷期： 2022 年 63 卷 012 期

页码： 2921-2923,2938

摘要： GDP-L-半乳糖磷酸化酶(GDP-L-galactose phosphorylase,GGP)是植物抗坏血酸(ascorbic acid,AsA)生物合成的一个关键酶.本研究利用生物信息学分析技术从克里曼丁橘基因组数据库中鉴定到4个GGP基因序列,分别位于4条不同染色体上,均含有内含子,氨基酸个数为307~455个,蛋白质二级结构以无规则卷曲和 α-螺旋为主.顺式作用元件预测柑橘GGP基因家族参与光、逆境胁迫和植物生长等响应.转录组数据显示,CsGGP2和CsGGP4是柑橘AsA生物合成起作用的家族成员,CsGGP2是主导成员,参与果皮早期发育;CsGGP4协同参与须根黄龙病胁迫.上述结果为进一步确定柑橘GGP家族基因的功能奠定基础.

分类号： S666.2

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