基于转录组测序枣胚发育过程差异表达基因分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 任海燕

作者： 任海燕;李登科;王永康;赵爱玲;薛晓芳;李毅

作者机构：

关键词： 枣;胚发育;转录组测序;差异表达基因

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2021 年 013 期

页码： 4334-4342

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探索枣胚发育的分子机理,本研究使用Illumina高通量测序平台对中度可育枣品种‘冷白玉’四个发育时期（原胚,小球形胚,心形胚,鱼雷形胚）的幼胚进行转录组测序,共获得135 743 080条高质量Reads,Q30>92.88%。样品间共筛选出2 333个差异表达基因,其中有19个差异表达基因是所有样品组合共有的。原胚与小球形胚的幼胚（L2 vs L3）间的差异表达基因（differentially expressed gene, DEG）基因数（867）明显多于其他组合,小球形胚与鱼雷形胚（L3 vs L5）间的DEG基因数（503）明显多于原胚与心形胚（L2 vs L4）间的DEG基因数（498）。GO富集分析显示,四个发育时期的DEG主要共同富集到分子功能、细胞组分、生物过程等GO条目。KEGG富集分析发现,四个时期的DEGs主要共同富集到次生代谢合成、代谢过程、植物信号转导通路,主要参与了苯丙氨酸代谢、α-亚麻酸代谢、氰氨基酸代谢、光合作用-天线蛋白质等代谢途径。通过转录组测序分析了不同发育阶段的‘冷白玉’枣幼胚差异基因表达状况,为寻找枣胚发育的相关基因提供理论参考。

分类号： S665.1

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