7个桑树AP2/ERF转录因子的生物信息学及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 董亚茹
作者: 董亚茹;李茹霞;赵东晓;耿兵;孙景诗;李云芝;王照红
作者机构:
关键词: 桑树;AP2/ERF转录因子;生物信息学分析;基因表达;非生物胁迫
期刊名称: 山东农业科学
ISSN: 1001-4942
年卷期: 2022 年 54 卷 001 期
页码: 7-13
收录情况: 北大核心
摘要: AP2/ERF类转录因子是植物所特有的一类转录因子家族,在植物的生长发育及响应非生物胁迫中发挥着重要作用.为发掘桑树AP2/ERF类转录因子的成员及其功能,从桂桑优12中克隆到7个AP2/ERF转录因子,命名为MnAP2/ERF1~MnAP2/ERF7.生物信息学分析结果表明,这7个AP2/ERF蛋白都属于不稳定蛋白,且均属于亲水性蛋白,二级结构以无规则卷曲为主,亚细胞定位显示主要位于细胞核中.氨基酸序列比对及进化树分析发现,这7个AP2/ERF转录因子均含有1个保守AP2结构域,其中MnAP2/ERF1~MnAP2/ERF4属于ERF亚家族,MnAP2/ERF5~MnAP2/ERF7属于DREB亚家族.荧光定量分析显示,NaCl、PEG6000、水淹胁迫可诱导7个桑树AP2/ERF基因上调表达,其中MnAP2/ERF3、MnAP2/ERF5、MnAP2/ERF6分别响应水淹、干旱和盐胁迫,说明桑树AP2/ERF转录因子的表达与逆境胁迫响应之间有密切的联系.本研究结果可为进一步揭示AP2/ERF转录因子调控桑树生长发育及逆境胁迫的机理奠定基础.
分类号: S888.3%Q786
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