虹鳟Hepcidin cDNA的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 姜娜

作者： 姜娜;马志宏;侯莉;邢薇;李铁梁;罗琳

作者机构：

关键词： 虹鳟;抗菌肽;Hepcidin;cDNA克隆;序列分析

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2012 年 28 卷 20 期

页码： 148-153

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了从虹鳟肝脏中扩增出Hepcidinc全长DNA序列,预测出氨基酸序列,并进行序列分析。通过RT-PCR和RACEPCR的方法,从虹鳟肝脏中克隆获得了Hepcidin全长cDNA序列,利用在线工具和软件包分析。结果表明:虹鳟Hepcidin全长cDNA序列(GenBank登录号HQ711993)为883bp,5’端非翻译区211bp,3’端非翻译区为405bp,以及一段267bp的编码序列,编码88个氨基酸,由信号肽(24个氨基酸)、原肽(39个氨基酸)和成熟肽(25个氨基酸)组成,成熟肽C端含有Hepcidin类抗菌肽的8个半胱氨酸保守性结构,可形成4个分子内二硫键。与已报道的鲑形目大西洋鲑Hepcidin氨基酸序列的一致性为93%,与其他鱼类Hepcidin氨基酸序列的一致性为44%~88%,是Hepcidin家族的新成员。

分类号： S917.4`Q78

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