甘蓝型油菜千粒重全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张春

作者： 张春;赵小珍;庞承珂;彭门路;王晓东;陈锋;张维;陈松;彭琦;易斌;孙程明;张洁夫;傅廷栋

作者机构：

关键词： 甘蓝型油菜;千粒重;产量;关联分析;SNP标记

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2021 年 47 卷 004 期

页码： 650-659

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 千粒重是油菜产量构成的重要因素之一.本研究利用高通量SNP芯片对496份具有代表性的油菜种质资源进行基因型分析,考察群体在3个环境(14NJ、15TZ、16TZ)中的千粒重表型,利用混合线性模型(mixed linear model,MLM)和一般线性模型(general linear model,GLM)进行全基因组关联分析.结果表明,本群体在3个环境中千粒重的广义遗传力为63.12%.MLM模型检测到6个显著位点,解释28.92%的表型变异;GLM模型检测到61个显著位点,解释47.08%的表型变异.合并共同位点后得到62个显著位点,联合解释47.31%的表型变异.这些位点分布在基因组所有染色体上,在A07、A03和C06染色体上分别检测到数目最多的9、8和7个位点.其中效应最大的位点Bn-scaff_17526_1-p1066214位于C09染色体,在MLM和GLM模型中表型贡献值分别为5.55%和15.26%.21个位点与前人报道的QTL重叠,其中8个位点得到至少2个群体的验证.其余41个位点为新鉴定的位点,其中多个位点效应高且在多环境中被检测到,如位点Bn-A03-p560769、Bn-scaff_15743_1-p599416和Bn-scaff_15743_1-p590955等.在11个位点附近找到DGAT、EOD3、AGL61、WRI1、DA2、RAV1等拟南芥已报道千粒重基因的同源基因.本研究结果有助于解析甘蓝型油菜千粒重的遗传基础,为研究千粒重的调控机制、指导千粒重的遗传改良奠定基础.

分类号：

  • 相关文献

[1]甘蓝型油菜每角粒数的全基因组关联分析. 孙程明,陈锋,陈松,彭琦,张维,易斌,张洁夫,傅廷栋. 2020

[2]甘蓝型油菜角果长度性状的全基因组关联分析. 孙程明,陈松,彭琦,张维,易斌,张洁夫,傅廷栋. 2019

[3]新疆冬小麦品种资源主要产量性状全基因组关联分析. 马艳明,娄鸿耀,张胜军,王威,郭营,倪中福,刘杰. 2023

[4]基于连锁不平衡水稻源库相关性状的关联分析. 赵宏亮,陈凯,张强,徐正进,徐建龙,黎志康. 2015

[5]用全基因组关联分析解析籼稻垩白的遗传基础. 邱先进,袁志华,陈凯,杜斌,何文静,杨隆维,徐建龙,邢丹英,吕文恺. 2015

[6]花后冠层温度对小麦产量的影响及几个关联SSR位点的效应分析. 张冬玲,张洪娜,郝晨阳,王兰芬,李甜,张学勇. 2015

[7]小麦转录因子TaMYB5-3B与株高和千粒重相关. 朱治,李龙,李超男,毛新国,郝晨阳,朱婷,王景一,常建忠,景蕊莲. 2023

[8]利用全基因组SNP芯片分析油菜遗传距离与杂种优势的关系. 桑世飞,王会,梅德圣,刘佳,付丽,王军,汪文祥,胡琼. 2015

[9]甘蓝型油菜分枝数QTL定位及其候选基因预测. 张凤启,程晓辉,刘越英,童超波,董彩华,于景印,黄军艳,刘胜毅. 2015

[10]油菜种子成熟度对千粒重和含油量性状的影响. 刘玉霞,汪义龙,丁瑜,陈飞,黄吉祥,倪西源,赵坚义. 2011

[11]甘蓝型油菜千粒重的遗传效应分析. 董育红,关周博,韦世豪,李少钦,郑磊,田建华. 2016

[12]甘蓝型油菜千粒重与农艺及品质性状的相关性. 赵继献,向阳,戴祥来,任廷波,胡权,程国平. 2020

[13]利用非条件和条件QTL解析油菜产量相关性状的遗传关系. 焦聪聪,黄吉祥,汪义龙,张晓玉,熊化鑫,倪西源,赵坚义. 2015

[14]利用IF_2群体定位油菜含油量和产量相关性状QTL. 程爽,孙中永,黄吉祥,曹明富,赵坚义. 2013

[15]利用青海大黄油菜和芥蓝合成大粒甘蓝型油菜. 富贵,赵志刚,杜德志. 2012

[16]敌草快对成熟期油菜脱水和种子质量的影响. 乔醒,程勇,陆光远,徐劲松,赵永国,王立辉,张学昆. 2015

[17]油菜开花期QTL定位及与粒重的遗传关联性. 黄吉祥,熊化鑫,潘兵,倪西源,张晓玉,赵坚义. 2016

[18]EMS诱变后甘蓝型油菜植株性状、种子粒重与含油量变异分析. 陈碧云,吕培军,张天瑶,许鲲,伍晓明. 2016

[19]甘蓝型油菜SSR标记遗传多样性及其与农艺性状关联分析. 李浩杰,张雪花,蒲晓斌,蒋俊,柴靓,崔成,蒋梁材. 2013

[20]甘蓝型油菜SnRK基因家族生物信息学分析及其与种子含油量的关系. 唐婧泉,王南,高界,刘婷婷,文静,易斌,涂金星,傅廷栋,沈金雄. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序