菠菜冷胁迫和热胁迫下转录组学和代谢组学联合分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宫瑞

作者： 宫瑞;张林琳;崔彦玲;陈海丽;李然红;潜宗伟

作者机构：

关键词： 菠菜;冷胁迫;热胁迫;转录组;代谢组;候选基因

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2024 年 39 卷 006 期

页码： 27-39

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 温度胁迫是影响菠菜品质和产量的主要非生物胁迫之一，研究菠菜对温度胁迫响应的分子机制对菠菜抗逆育种具有重要意义。为给菠菜抗冷胁迫、热胁迫机制研究提供理论基础，以菠菜耐冷胁迫自交系D3和耐热自交系M10为试验材料，对其在冷胁迫和热胁迫下的转录组和代谢组进行了分析，以期探讨菠菜抗逆的转录和代谢机制。转录组学分析表明，在冷胁迫和热胁迫下，耐冷自交系D3和耐热自交系M10的差异基因富集最多的途径基本相同。代谢组学分析表明，冷胁迫下在基因与基因组数据库(KEGG)富集通路中共同富集在嘧啶代谢、赖氨酸降解通路中；热胁迫下在KEGG富集通路中共同富集在色氨酸代谢，甲苯降解，各种其他次生代谢物的生物合成，甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸的代谢通路中；转录组学和代谢组学联合分析结合基因注释，确定了SpADH(sov2g036390)、SpSHMT(sov1g001130)、SpALDH-1(sov4g007150)为菠菜耐冷胁迫的候选基因，SpALDH-1(sov4g007150)、SpALDH-2(sov1g043320)、SpNPC(sov1g040610)为菠菜耐热胁迫的候选基因，其中，SpALDH-1(sov4g007150)在冷胁迫和热胁迫下都显著表达，可能是菠菜抗逆的相关调控基因。

分类号： S636.1

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