雷蒙德氏棉PIF-like转座元件鉴定与特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐珍珍

作者： 徐珍珍;彭珍;刘静;沈新莲;杜建厂

作者机构：

关键词： PIF-like转座元件;雷蒙德氏棉;生物信息学;基因组

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2016 年 28 卷 02 期

页码： 138-143

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： PIF-like转座元件在植物基因组中含量丰富,是植物DNA转座子的重要组成部分。利用基因组学和生物信息学的研究手段,系统研究了雷蒙德氏棉全基因组水平PIF-like转座元件的数量、染色体分布、结构特征、表达模式及相邻基因的种类和功能等,共鉴定了440条包含转座酶且插入位置明确的PIF-like转座元件。这些元件几乎均匀地分布在13条染色体上,上下游2 kb内共有171个相邻编码蛋白的基因,其中132个基因注释到了GO数据库中,且这些基因的功能分布广泛;部分PIF-like转座元件表达,且具有组织特异性。这些遗传信息为深入研究棉花PIF-like转座元件介导的基因和基因组的进化规律以及棉花基因的功能奠定基础。

分类号： S562

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