槟榔果实不同发育时期的转录组分析及差异基因的筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 严和琴

作者： 严和琴;于靖;郑蔚;李杨;刘立云;李志刚

作者机构：

关键词： 槟榔;果实发育时期;转录组;差异表达基因

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2023 年 014 期

页码： 4595-4605

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探知槟榔（Areca catechu L.）果实发育过程及挖掘其主要次生代谢产物生物合成途径相关的关键酶基因，本研究以3个不同时期的槟榔果皮和种子为研究材料，利用高通量测序技术测序，组装共获得78320条unigenes，其中35 399条unigenes在NR、Swiss-Prot、KOG、KEGG四大数据库得到注释。在错误发现率FDR＜0.05、差异倍数FC （Fold Change）≥2的条件下，G140和S140的差异表达基因共有21 065个，其中上调的有11 811个，下调的有9 254个；G110和S140次之，共有20 613个unigenes，其中上调的有8 314个，下调的有12 299。KEGG分析中共有570个DEGs被注释到次生代谢标准生物合成通路。其中，有149个DEGs被注释到苯丙烷生物合成途径，分别有37个DEGs被注释到莨菪烷类、哌啶和哌啶生物碱生物合成和异喹啉生物碱生物合成途径。RT-qPCR结果表明转录组数据真实可靠。本研究初步筛选了与槟榔主要次生代谢物生物合成相关的关键酶基因，为槟榔基因功能鉴定、次生代谢途径解析及调控机制的研究提供理论依据。

分类号： S567.19

  • 相关文献

[1]基于高通量测序的青花菜早期发育小孢子转录组分析与基因功能注释. 张振超,姚悦梅,毛忠良,孙国胜,秦文斌,戴忠良. 2018

[2]感染球孢白僵菌的家蚕免疫应答差异表达基因分析. 侯成香,覃光星,耿涛,高坤,潘中华,钱荷英,郭锡杰. 2014

[3]福清山羊和戴云山羊夏季发情期卵巢组织比较转录组分析. 吴贤锋,李文杨,刘远,张莹,黄勤楼. 2019

[4]外源赤霉素诱导矮生山茶恨天高植株生长的转录组分析. 王江英,朱朋波,汤雪燕,孙明伟,葛金涛,赵统利,李纪元,惠林冲,邵小斌. 2020

[5]玫瑰茄转录组测序及花青素合成相关基因表达分析. 练冬梅,赖正锋,姚运法,张少平,林碧珍,洪建基. 2020

[6]美国红枫叶片转录组分析. 郭聪,王莹,谈峰,陈燕,李玉娟. 2020

[7]感染和未感染南方水稻黑条矮缩病毒的白背飞虱成虫唾液腺转录组比较分析. 刘玉娣,王香萍,侯茂林. 2018

[8]马铃薯萌芽出苗期根系对水分胁迫的响应机理分析. 王晓娇,蒙美莲,曹春梅,逯春杏,许飞. 2019

[9]福清山羊与努比亚黑山羊背最长肌比较转录组分析. 刘远,李文杨,吴贤锋,黄勤楼,高承芳,陈鑫珠,张晓佩. 2019

[10]红白果肉颜色火龙果果肉转录组分析和基因功能注释. 吴亚维,徐娟,韩秀梅,张兴无,洪怡,文晓鹏. 2019

[11]硒处理下冰菜的转录组响应及相关基因功能分析. 姚运法,练冬梅,林碧珍,赖正锋,洪建基. 2021

[12]亚麻响应低钾胁迫转录谱分析. 黄文功,姜卫东,姚玉波,宋喜霞,刘岩,陈思,赵东升,吴广文,袁红梅,任传英,孙中义,吴建忠,康庆华. 2021

[13]低温胁迫对冰菜转录组水平响应分析. 赖正锋,姚运法,林碧珍,练冬梅,洪建基. 2021

[14]卡尼鄂拉蜂越冬工蜂咽下腺转录组学分析. 范荣莉,王康,蔺哲广,张文文,刘振国,梁勤,陈国宏,吉挺. 2020

[15]植物响应干旱的转录组学研究进展. 倪知游,梁东,高帆,胡容平,夏惠. 2018

[16]花椰菜苗期黑腐病抗、感品种转录组差异表达分析. 姚玉荣,霍建飞,郝永娟,贲海燕,王万立. 2020

[17]基于RNA-Seq分析褪黑激素对绒山羊皮肤基因表达的影响. 丽春,付绍印,王建蒙,王位. 2018

[18]低温诱导稻曲病菌菌核形成的转录组学分析. 吕楚阳,邓平川,张晓丽,孙钰超,梁五生,胡东维. 2020

[19]黄秋葵对南方根结线虫抗性的转录组分析. 练冬梅,赖正锋,姚运法,林碧珍,洪建基. 2020

[20]鸭不同羽色毛囊组织差异表达基因转录组测序分析. 蒋兵兵,黄曼曼,白天,曾涛,陈黎,沈军达,陶争荣,周玮,刘国发,卢立志,李海英. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序