2015年中国典型对虾养殖区WSSV流行株高变异区序列的分析比较
文献类型: 中文期刊
第一作者: 秦梦雪
作者: 秦梦雪;孙新颖;万晓媛;刘庆慧;黄倢
作者机构:
关键词: WSSV;ORF;缺失;变异
期刊名称: 渔业科学进展
ISSN: 2095-9869
年卷期: 2018 年 02 期
页码: 128-137
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了解我国白斑综合征病毒(WSSV)流行变异特征,本研究对2015年4~10月期间在山东、江苏、天津、浙江、海南和广东6省市采集到的57份WSSV阳性的样本,通过特异性的扩增目的片段,根据测序结果分析比较不同地区、不同分离株之间在ORF14/15、ORF23/24上的缺失变异情况,以及ORF75、ORF94和ORF125上的重复单元(Repeat unit,RU)数目差异。结果显示,在ORF14/15扩增中,分别有6530、5908和5725 bp的片段缺失,而在ORF23/24扩增中均有12070 bp大片段的缺失,ORF75的45 bp的RU数目分别为1、2和3,102 bp的RU数目均为1,而ORF94的RU数目分别为4、5、10和12不等,ORF125的RU数目为3、5和6。结果表明,WSSV在部分开放型阅读框上表现出明显的变异差异,而在某些开放型阅读框上的缺失情况则有显著的稳定性。
分类号: S945.4
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