萝卜属抽薹开花相关基因FLC的预测及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭军

作者： 郭军;祖艳侠;吴永成;郑佳秋;梅燚

作者机构：

关键词： 十字花科;萝卜属;开花时间基因

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN： 1004-1524

年卷期： 2014 年 26 卷 03 期

页码： 656-660

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以控制拟南芥春化途径的关键基因FLC全长CDS为参考序列,在萝卜属(Raphanus)EST数据库中进行BLASTN检索,得到具备Score≥100、E-value≤10-10和coverage≥70%条件的70条萝卜ESTs作为候选的拟南芥FLC基因的同源ESTs,并进行序列聚类拼接、注释及分析。结果显示:在普通萝卜和野生萝卜中各发现两个旁系同源基因(RsFLCa和RsFLCb及RrFLCa和RrFLCb)。RFLCs与拟南芥FLC间在核酸水平上的一致性为78.7%~86.9%;RFLCs旁系同源基因间的一致性为75.9%~93.4%;RFLCs与芸薹属FLC直系同源基因间的一致性绝大多数维持在85%以上,且高于与拟南芥直系同源基因间的一致性。系统进化分析发现,与白菜、甘蓝及甘蓝型油菜中FLC多拷贝产生的机制可能类似,萝卜属FLC基因的多拷贝现象可能也是伴随萝卜基因组的多倍化而产生的。

分类号： S631.1

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