基于高密度遗传图谱的粳稻苗期耐冷QTL分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 杨传铭

作者: 杨传铭;王立志;张喜娟;杨贤莉;王洋洋;侯本福;崔士泽;李青超;刘凯;马瑞;冯延江;来永才;李红宇;姜树坤

作者机构:

关键词: 粳稻;高密度连锁图谱;苗期;耐冷;数量性状位点

期刊名称: 中国水稻科学

ISSN: 1001-7216

年卷期: 2025 年 39 卷 001 期

页码: 82-91

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】低温冷害是影响水稻生长发育,进而造成不同程度减产的主要气象灾害之一。挖掘鉴定耐冷基因,选育耐冷品种,是解决水稻低温冷害最简单、直接和有效的手段之一。【方法】利用丽江新团黑谷/沈农265衍生的包含144个株系的重组自交系群体,通过人工气候室进行苗期耐冷性鉴定。结合全基因组重测序构建的包含2828个bin标记的高密度遗传图谱,进行苗期耐冷性QTL定位和互作分析。【结果】利用完备区间作图法共检测到4个苗期耐冷QTL,分别定位于水稻的1、8、10和12号染色体上,单个QTL的表型贡献率为5.33%~19.86%。其中,q CTS1、q CTS10和q CTS12的增效等位基因来源于强耐冷亲本丽江新团黑谷,q CTS8的增效等位基因来源于沈农265。主效QTLq CTS12定位在12号染色体的15.98Mb-16.37 Mb之间,物理图谱区间为396.67 Kb。q CTS1定位在1号染色体的9.20 Mb-9.50 Mb间,物理图谱区间为299.85 kb。q CTS8定位在8号染色体的26.09Mb-26.15 Mb之间,物理图谱区间为55.05Kb。q CTS10定位在10号染色体的11.13Mb-11.21Mb间,物理图谱区间为85.82kb。进一步分析发现,除q CTS1-q CTS8之间存在负向互作外,其余QTL间的互作表现为加性效应。【结论】利用丽江新团黑谷和沈农265的重组自交系群体,结合包含2818个bin标记的遗传图谱,共检测到4个苗期耐冷QTL,其中3个QTL的增效等位基因来自强耐冷地方品种丽江新团黑谷。可为耐冷分子设计育种提供有用的基因资源,同时为阐明水稻苗期耐冷的遗传和分子机制提供参考。

分类号: S511.22

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