我国大蒜潜隐病毒的基因组结构及3’端序列的变异
文献类型: 中文期刊
第一作者: 陈炯
作者: 陈炯;陈剑平;郑红英;杨崇良
作者机构:
关键词: 大蒜潜隐病毒;核苷酸序列;基因组结构;变异
期刊名称: 中国科学(C辑:生命科学)
ISSN: 1006-9259
年卷期: 2002 年 32 卷 03 期
页码: 225-231
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 从我国6个省市12个大蒜样品上共检出10个不同的香石竹潜隐病毒属(Carlavirus)分离物,测定了浙江分离物ZJ1的基因组全序列和其他9个分离物的基因组3'端序列.ZJ1分离物RNA基因组全长8363个核苷酸,3'端具polyA尾,含6个可读框(ORF),分别编码复制酶,TGB1,TGB2,TGB3,CP和NABP,基因组结构和其他Carlavirus属成员相似.序列分析表明,10个分离物均为大蒜潜隐病毒(GarLV),不同分离物TGB2,TGB3和NABP的差异大于CP的差异,且这些分离物和葱潜隐病毒(ShLV)也具有很高的同源性.系统进化树分析表明,大蒜来源的GarLV分离物可以分成4个类群,我国分离物分别属于4个不同类群.
分类号: S432.41
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