木薯SYP基因的序列特征及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李文绮

作者： 李文绮;阮孟斌;王斌;赵平娟;彭明

作者机构： 石河子大学生命科学学院农业生物技术重点实验室;中国热带农业科学院热带生物技术研究所/农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室

关键词： 木薯;SYP基因;进化树;基因表达

期刊名称： 植物学报

ISSN： 1674-3466

年卷期： 2014 年 49 卷 01 期

页码： 63-77

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 植物突触融合蛋白(SYP)是一类与植物细胞内囊泡介导转运有关的蛋白。部分SYP基因与植物对生物和非生物胁迫的响应有关。该文利用生物信息学工具分析了木薯(Manihot esculenta)SYP基因及其蛋白结构、核苷酸多态性和系统进化关系,并利用RT-PCR技术检测了木薯不同组织中SYP基因的表达。结果表明,木薯SYP基因及其蛋白结构均具有明显的规律性和家族成员间的保守性;SYP基因的cDNA在基因间以及不同品种间具高度一致性,核苷酸变异以同义替换为主。进化分析表明,植物SYP基因可分为2个亚家族,木薯SYP基因倾向于与蓖麻(Ricinus communis)SYP基因聚在进化树同一分支的末端。半定量RT-PCR分析表明,5个木薯SYP家族成员具有组织特异性。上述研究结果为木薯SYP基因功能研究和功能单核苷酸标记的开发奠定了重要基础。

分类号： S533

  • 相关文献

[1]普通烟草CDPK基因家族的克隆及表达分析. 太帅帅,刘贯山,孙玉合,陈珈. 2009

[2]绒毛状烟草钙依赖蛋白激酶基因家族分析. 张丽,张磊,康乐,王军伟,王鲁,龚达平,刘贯山. 2012

[3]烟草抗马铃薯Y病毒病相关基因NtPsaN的克隆及表达分析. 周佳,李凤霞,陈帅,罗成刚,刘贯山,蒋彩虹,杨爱国,苏振刚,王元英. 2010

[4]玉米11个ZmbZIP基因的鉴定及表达特征分析. 贾利强,刘洋,赵秋芳,陈曙. 2022

[5]木薯华南8号及其四倍体块根淀粉代谢相关基因表达分析. 安飞飞,冷青云,李开绵,陈松笔. 2018

[6]外源ABA对木薯叶片内源激素及淀粉合成相关基因的影响. 王淑娟,方开星,陈新,马平安,周新成,卢诚,王文泉. 2015

[7]木薯不同品种(系)生物积累量特性及其与淀粉积累关键基因表达相关性研究. 覃琼瑶,卢诚,陈新,孙玉芳,王文泉. 2016

[8]MeNINVs在不同品种木薯的表达模式及酶活性分析. 姚远,耿梦婷,吴晓慧,王运林,孙冲. 2016

[9]木薯MeHB2转录因子的克隆与表达分析. 丁泽红,付莉莉,铁韦韦,颜彦,夏志强,王文泉,胡伟. 2016

[10]木薯MeP5CS1基因的克隆、表达分析及载体构建. 丁泽红,付莉莉,黄猛,颜彦,铁韦韦,张家明,胡伟. 2017

[11]二斑叶螨抗性木薯木质素合成途径基因表达特性研究. 姚晓文,梁晓,陈青,伍春玲,刘迎,刘小强,税军,乔阳,毛奕茗,陈银华,张银东. 2023

[12]花生AhCDPK32基因克隆及表达载体的构建. 张青云,孙全喜,唐月异,王秀贞,吴琪,王云云,曹广英,祁雪,王传堂. 2016

[13]新疆奶牛乳源大肠杆菌Irp2毒力岛的克隆及序列分析. 吐尔洪·努尔,王世民,苏艳. 2010

[14]番茄斑萎病毒属病毒的多样性. 程晓非,武晓云,李凡,李正跃,董家红,张仲凯. 2007

[15]中国白梨PbSFBB 13-gamma基因的分子克隆与序列特征(英文). 张琳,谭晓风,胡姣,乌云塔娜,袁德义. 2009

[16]几种经济植物UFGT基因的生物信息学分析. 付海辉,辛培尧,许玉兰,刘岩,韦援教,董娇,曹有龙,周军. 2011

[17]清水江鲤性腺的早期发育及Foxl2基因功能初步分析. 曾圣,刘伟,杜强,王艳艳,周洲,胡世然. 2020

[18]腺病毒7d基因型与7b基因型全基因组比较分析. 任洛,付扬喜,郑首燕,王鹂鹂,倪科,王莉佳,臧娜,谢晓虹,邓昱,刘恩梅. 2017

[19]山西省獭兔源葡萄球菌16s基因序列及进化树分析. 王国艳,孙乐天,樊爱芳,曹亮,李燕平,任克良. 2018

[20]紫花苜蓿果糖-1,6-二磷酸醛缩酶基因全长克隆及分析. 龙瑞才,杨青川,康俊梅,王凭青,秦智慧. 2010

作者其他论文 更多>>

微信小程序