新疆冬小麦品种资源主要产量性状全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马艳明

作者： 马艳明;娄鸿耀;张胜军;王威;郭营;倪中福;刘杰

作者机构：

关键词： 小麦;产量性状;SNP标记;关联分析;候选基因

期刊名称： 中国农业科学

ISSN：

年卷期： 2023 年 018 期

页码： 3487-3499

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]高产是小麦育种的永恒主题,利用全基因组关联分析发掘控制小麦产量性状的QTL区段及优异基因,为小麦分子标记辅助选择育种提供理论依据和标记信息.[方法]以新疆本地188个冬小麦品种资源为材料,利用小麦55K SNP芯片进行全基因组扫描,通过对6个不同环境下的株高、穗长、小穗数、可育小穗数、穗粒数、千粒重、粒长、粒宽、籽粒长/宽比9个产量相关性状进行表型鉴定,利用6个环境下各性状数据及最佳线性无偏预测(BLUP)数据,基于混合线性模型(MLM)对表型和基因型进行全基因组关联分析.[结果]经主成分分析,将188个材料分为地方品种和育成品种2个亚群;利用6个环境下各性状数据,9个性状共检测到1309个显著性SNP标记,其中,每个显著性SNP位点可解释7.259%-70.792%的表型变异.利用BLUP数据,9个性状共检测到66个显著性位点,同时与2个性状关联的共有SNP位点有5个,贡献率波动范围为8.498%-21.877%.将同时与2个性状或2个以上环境关联到的重复位点作为稳定的显著性关联位点,9个性状共检测到38个稳定关联位点,包括株高重复位点5个,穗长重复位点10个,小穗数重复位点10个,结实小穗数重复位点6个,穗粒数重复位点6个,千粒重重复位点1个,可解释9.10%-23.81%的表型变异.将这38个位点与已发布小麦基因组位点比对,仅找到3个与本研究关联重复位点位置相近、且有注释基因功能的基因,分别是:2A染色体上与株高关联位点AX-108794050距离相近的TraesCS2A01G448800,与转录因子bHLH71的代谢合成有关;1A染色体上与穗长关联位点AX-110689765距离相近的TraesCS2A01G448800,与蛋白质编码有关;4B染色体上与千粒重关联位点AX-110399975距离相近的TraesCS4B01G031100,与编码丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶SD1-8有关,参与对细胞增殖与分化的调控.[结论]检测到38个与小麦产量性状关联的QTL位点,关联的优良等位基因具有降低株高、增加穗长、小穗数、可育小穗数、穗粒数和千粒重的作用.

分类号： S51

  • 相关文献

[1]基于高密度SNP标记对玉米穗部相关性状的QTL定位及候选基因分析. 赵强,陈柔屹,王安贵,郭向阳,刘鹏飞,祝云芳,吴迅,陈泽辉. 2021

[2]冬小麦籽粒主要品质性状的全基因组关联分析. 董一帆,任毅,程宇坤,王睿,张志辉,时晓磊,耿洪伟. 2023

[3]甘蓝型油菜每角粒数的全基因组关联分析. 孙程明,陈锋,陈松,彭琦,张维,易斌,张洁夫,傅廷栋. 2020

[4]甘蓝型油菜角果长度性状的全基因组关联分析. 孙程明,陈松,彭琦,张维,易斌,张洁夫,傅廷栋. 2019

[5]甘蓝型油菜千粒重全基因组关联分析. 张春,赵小珍,庞承珂,彭门路,王晓东,陈锋,张维,陈松,彭琦,易斌,孙程明,张洁夫,傅廷栋. 2021

[6]基于连锁不平衡水稻源库相关性状的关联分析. 赵宏亮,陈凯,张强,徐正进,徐建龙,黎志康. 2015

[7]用全基因组关联分析解析籼稻垩白的遗传基础. 邱先进,袁志华,陈凯,杜斌,何文静,杨隆维,徐建龙,邢丹英,吕文恺. 2015

[8]芝麻产量相关性状全基因组关联分析. 崔向华,隗正阳,杜振伟,周霞丽,刘焱,石明权,阚跃峰,张少泽,崔承齐,梅鸿献. 2023

[9]水稻中胚轴伸长相关候选基因的关联分析. 刘金栋,王雅美,刘宏岩,孟云,叶国友. 2023

[10]柚果肉颜色遗传变异分析及候选基因挖掘. 程莉,杨胜男,朱延松,王旭,赵婉彤,李仁静,李沛,苑忠杰,江东. 2023

[11]玉米产量相关性状Meta-QTL及候选基因分析. 江培顺,张焕欣,吕香玲,郝转芳,李博,李明顺,王宏伟,慈晓科,张世煌. 2013

[12]陆地棉主要产量相关性状的SSR标记关联分析. 王娟,董承光,刘丽,孔宪辉,王旭文,余渝. 2017

[13]关联分析在水稻产量性状遗传研究中的应用. 卢钰霞,张再君,田志宏. 2021

[14]陆地棉农艺性状与SSR标记的关联分析. 梁冰,范术丽,宋美珍,庞朝友,魏恒玲,喻树迅. 2014

[15]基于SNP分子标记的泰山/泰科麦系列小麦遗传解析. 亓晓蕾,李兴锋,吕广德,王瑞霞,王君,孙宪印,孙盈盈,陈永军,钱兆国,吴科. 2021

[16]普通小麦抗倒伏相关性状的全基因组关联分析. 于海飞,杜晓宇,殷贵鸿,邹少奎,李楠,张倩,吕永军,王丽娜,王雅美,韩玉林. 2022

[17]利用55K芯片进行小麦生育期相关性状的QTL定位及效应分析. 温明星,肖进,徐涛,孙丽,王宗宽,王海燕,王秀娥. 2023

[18]蚂蚱麦和小白麦衍生系的遗传多样性分析. 白彦明,李龙,王绘艳,柳玉平,王景一,毛新国,昌小平,孙黛珍,景蕊莲. 2019

[19]小麦品系CH7034中耐盐QTL定位. 张潇文,李世姣,张晓军,李欣,杨足君,张树伟,陈芳,常利芳,郭慧娟,畅志坚,乔麟轶. 2022

[20]山西省同名小麦地方品种的遗传关系分析. 雷梦林,刘霞,王艳珍,穆志新. 2023

作者其他论文 更多>>

微信小程序