火龙果热激转录因子HSF基因家族鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 邓健炜

作者： 邓健炜;孙清明;申迎宾;李俊成

作者机构：

关键词： 火龙果;HSF基因家族;热激转录因子;生物信息学

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2025 年 40 卷 003 期

页码： 280-290

摘要： 【目的】探究火龙果（Selenicereus spp.）热激转录因子（heat shock transcription factors, HSF）基因家族的生物学特性，为探明火龙果抵抗高温胁迫反应机制提供依据。【方法】运用生物信息学手段，对火龙果HSF基因家族进行理化性质、Motif分析、基因结构分析、基因结构域的预测、染色体定位、启动子分析和系统进化树分析等。并通过转录组数据和qPCR技术分析基因家族各成员在逆境胁迫的表达情况。【结果】从火龙果基因组中鉴定出13个HSF基因家族成员。理化性质分析结果表明，其编码的热转录因子均为不稳定蛋白；基因结构分析显示，火龙果HSF基因家族大部分成员仅含一个内含子；系统进化树分析结果表明，火龙果HSF基因家族根据亲缘关系分为4类，Motif分析结果也从侧面印证同一分支的基因具有相似或相同的保守基序；HSF基因家族成员随机分布在火龙果的6条染色体中；其启动子中包含激素响应、逆境胁迫、植物生长发育调控和光响应等多种元件；基因结构域预测分析发现，火龙果HSF基因家族成员均含有特定的HSF结构域。基因表达分析表明，火龙果HSF基因的表达具有较强的时间与空间特异性；其中仅5个成员在枝条表达且表达趋势不同，HU05G00210.1和HU05G01887.1的表达量在24 h和48 h均显著升高，HU02G02398.1和HU10G01257.1在经过48 h高温处理后表达量才显著升高，而HU04G00163.1表达量则没有显著变化，体现了HSF基因对热胁迫的响应。【结论】初步鉴定并验证了HSF基因家族成员参与了火龙果热胁迫反应过程，为进一步探究HSF基因家族成员在火龙果高温响应机制提供参考。

分类号： S667.9

  • 相关文献

[1]芥菜全基因组中Hsf基因家族鉴定与分析. 杨巍,唐兵,谭国飞,付文苑,王青青,曾庆鸿,王洪亮,马建云,张睿,施绍斌,邓英. 2023

[2]大白菜和甘蓝热激转录因子基因家族鉴定及比较分析. 黄小云,陶鹏,王五宏,李必元,岳智臣,雷娟利,钟新民. 2014

[3]苋菜Hsf家族基因全基因组鉴定及其在高温胁迫下的表达分析. 张爱冬,田梓萌,肖凯,颜丽美,查丁石,吴雪霞. 2025

[4]木薯MeHSF8基因克隆及表达分析. 曾坚,莫嘉嘉,吴春来,胡伟. 2020

[5]植物响应高温胁迫的信号转导和转录调控机制研究进展. 王改妮,白万鹏,王锁民. 2020

[6]木薯MeHSF18基因克隆及表达分析. 曾坚,黄芷颐,章玉香,吴春来,胡伟. 2020

[7]作物耐热生理基础与基因发掘研究进展. 吴昊,李燕敏,谢传晓. 2018

[8]水稻锌指蛋白基因OsBBX24响应热胁迫的研究. 骆鹰,谢旻,王伟平,黎妮,饶力群,汪启明. 2017

[9]水稻HSF基因OsHsf-like的生物信息学和转录表达分析. 万丙良,查中萍,杜雪树,戚华雄. 2008

[10]水稻锌指蛋白基因O_sBBX22响应热胁迫的功能分析. 谢旻,张超,王伟平,朱建华,万向元,汪启明,饶力群. 2018

[11]辣椒‘9704A’雄性不育特异基因hsf的克隆及表达分析. 彭彦,赵燕,刘峰,张学文. 2014

[12]普通烟草热激转录因子家族的全基因组鉴定与分析. 郭存,王奇,李晓旭,张震彪,文利超,邓智超,初雨蒙,刘涛,崔萌萌,郭永峰. 2022

[13]高等植物热激转录因子生物学特性及其在非生物胁迫适应中的作用. 邵坤仲,吕昕培,李佳吕,陈佳,赵玲玉,任伟,张金林. 2022

[14]植物热激转录因子研究进展. 査中萍,万丙良. 2009

[15]非生物胁迫对橡胶树热激转录因子家族成员表达的影响. 李言,余文才,陆庆志,杨署光,田维敏. 2021

[16]植物热激转录因子基因家族的研究进展. 黄小云,陶鹏,李必元,王五宏,岳智臣,雷娟利,钟新民. 2014

[17]玉米热激转录因子基因ZmHsf06表达提高拟南芥耐盐性. 李国良,李孟军,刘子会,张华宁,郭秀林. 2016

[18]转GmHSFA1基因大豆的耐热性评价. 吴广锡,刘丽君,杨德光,唐晓飞,魏崃,王鹏飞,王兴宇. 2012

[19]拟南芥热激转录因子AtHsfA6a的克隆与细胞定位分析. 晁旭,巩振辉,逯明辉,马超,李大伟,赵军,孟长军. 2008

[20]钙—钙调素热激信号转导途径研究进展. 周人纲,李冰,刘宏涛,孙大业. 2009

作者其他论文 更多>>

微信小程序