福氏2a志贺菌DNA转录激活蛋白MarA的二级结构及其B细胞抗原表位预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 魏小娟

作者： 魏小娟;张继瑜;王松泰;李剑勇;周旭正;牛建荣;李金善

作者机构：

关键词： 福氏2a志贺菌;DNA结合转录激活蛋白MarA;二级结构;B细胞表位

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2009 年 21 期

页码： 1-3

收录情况： 北大核心

摘要： 研究以福氏2a志贺菌(Shigella flexneri2a,s.f2a)的基因组序列为材料,采用Gamier-Robson法、Chou-Fasman法和Kamplus-Schulz法预测了其DNA结合转录激活蛋白MarA的二级结构,用Kyte-Doolittle法对结构蛋白的亲水性进行了分析,用Emini法预测了蛋白的表面可能性,以Jameson-Wolf法预测了蛋白的抗原指数,然后综合评价了福氏2a志贺菌转录激活蛋白MarA的B细胞抗原表位。结果表明:福氏2a志贺菌MarA蛋白的二级结构较为复杂,含有较多的转角和无规则卷曲等柔性区域以及α-螺旋和β-折叠区段,该蛋白有多处抗原指数较高的区段,其中含有潜在的B细胞优势抗原表位,因此其在免疫学中的地位也应当引起重视。

分类号： S852.61

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