藏猪出生重的全基因组关联分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 胡斌
作者: 胡斌;蔡淑芳;孟繁明;辛海云;王塑天;李宝红;程蕾燕;李剑豪
作者机构:
关键词: 猪;出生重;全基因组关联分析;SNP
期刊名称: 广东畜牧兽医科技
ISSN: 1005-8567
年卷期: 2021 年 006 期
页码: 40-44
摘要: 出生体重是影响仔猪质量和存活的一个重要性状。本研究利用206头藏猪仔猪群体,提取耳组织样品DNA并利用猪50K SNP芯片进行基因分型,分型结果经质控与基因型填充后,采用单变量混合线性模型的全基因组关联分析(GWAS),筛选该群体的出生重性状相关基因。结果显示:GEMMA软件共检测到5个达到染色体显著水平(P<5.6*10-6)的SNP位点,筛选了TMC1、PRUNE2、FOXB2、XIRP2、ENSSSCG00000005264、ENSSSCG00000022408和ENSSSCG00000030243作为出生重性状候选基因,为后续通过分子育种手段提升藏猪出生重性状奠定了基础。
分类号: S828
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