2017年中国部分地区白斑综合征病毒3个基因的 变异分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘晓娉

作者： 刘晓娉;蔡苗;刘庆慧;万晓媛;黄倢

作者机构：

关键词： 白斑综合征病毒;wsv-pol;wsv313;wsv150;序列分析

期刊名称： 水产科学

ISSN： 1003-1111

年卷期： 2020 年 39 卷 004 期

页码： 560-566

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 白斑综合征病毒广泛分布于中国、东南亚、南亚、南美洲、北美洲的许多国家,并且具有较高的致病性.为探明中国不同地区白斑综合征病毒毒株的变异情况,本研究选取2017年2—6月在河北、浙江、山东、上海、福建和广东共6个省市的白斑综合征病毒病害暴发区的44份患病样本,提取其DNA,进行wsv-pol、wsv313、wsv150的PCR扩增,筛选阳性克隆并进行测序分析.分析结果显示,在2017年wsv-pol的12个阳性样本中,均在第164位出现单个甘氨酸缺失,在个别样品中也存在氨基酸的替换现象;在wsv313的PCR扩增中有9个阳性样本在第280位插入1个脯氨酸,2个样本在第64位天冬氨酸突变为甘氨酸;wsv150的阳性样本均在第587位插入碱基T.氨基酸比对结果显示,8个样本在第200位之后出现106个大片段氨基酸的缺失,同时在第196、197、198、199位发生氨基酸的替换.氨基酸比对结果表明,wsv-pol、wsv313均未出现较大程度的变异,而wsv150的氨基酸序列出现了较大程度的变异,但未表现出地区差异性.本研究将为白斑综合征病毒病原学的研究提供依据.

分类号： Q78

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