花生共生受体类蛋白激酶基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 段小红

作者： 耿丽丽;束长龙;朱延明;张杰

作者机构：

关键词： 基因组步移;共生受体类蛋白激酶;生物信息学;RT-PCR

期刊名称： 中国农业科技导报

ISSN： 1008-0864

年卷期： 2012 年 14 卷 05 期

页码： 33-41

收录情况： 北大核心

摘要： 共生受体类蛋白激酶(symbiosis receptor-like protein kinase,SYMRK)是控制植物与微生物共生的关键调控基因,利用基因组步移技术,克隆得到花生symrk的全长基因及其560 bp的ATG上游序列。采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的常规理化性质、跨膜结构域、亚细胞定位和高级结构等进行了预测和分析,结果表明Ah-symrk由15个外显子和14个内含子组成,cDNA全长3 042 bp,包含2 781 bp的ORF,编码926个氨基酸,为疏水性酸性蛋白质,定位于细胞膜;ATG上游序列包含3个与根特异表达有关的顺式作用元件root motif tapox1;RT-PCR验证,该基因在花生根中特异性表达。

分类号： S565.2

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