混合感染番木瓜PRSV/PLDMV株系基因组全长cDNA的克隆和实时荧光定量PCR分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘芳

作者： 刘芳;庹德财;沈文涛;言普;黎小瑛;周鹏

作者机构：

关键词： 混合感染;PRSV;PLDMV;序列分析;绝对定量

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2016 年 37 卷 04 期

页码： 742-751

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 番木瓜环斑病毒(Papaya ringspot virus,PRSV)与番木瓜畸形花叶病毒(Papaya leaf distortion mosaic virus,PLDMV)存在混合感染的现象,近年来混合感染发病率逐年递增,是一种新的威胁番木瓜种植业的病毒病害。运用RT-PCR和RACE方法从混合感染样品中克隆获得2种病毒基因组全长c DNA,分别命名为PRSV-LM和PLDMV-LM,Gen Bank登录号分别为KT633943和KT633944,基因组序列大小分别为10 325、10 153 nt(不包括3′端的poly A)。序列分析表明:PRSV-LM与单独感染样品中的PRSV海南分离物HN(Gen Bank登录号:EF183499)的核苷酸序列和氨基酸序列相似性最高,为94%;PLDMV-LM与单独感染样品中的PLDMV海南分离物Hainan-DF(Gen Bank登录号:JX974555)核苷酸和氨基酸序列相似性最高,分别高达99%和97%。进化树分析显示,PRSV-LM和PLDMV-LM分别与单独感染样品的PRSV和PLDMV海南分离物有共同的进化起源。进一步利用实时荧光定量PCR对混合感染样品的PRSV与PLDMV病毒积累量进行分析,结果表明,混合感染样品中PLDMV病毒积累量大约是PRSV含量的100倍。研究结果为进一步探究PRSV/PLDMV混合感染发病机制奠定基础。

分类号： S436.67

  • 相关文献

[1]海南地区番木瓜花叶病病原的分子鉴定与多样性分析. 张雨良,黄启星,朱丽娣,孔华,曾会才. 2014

[2]海南番木瓜PRSV和PLDMV病毒发生情况及分子鉴定. 张雨良,黄启星,郭安平,曾会才,赵辉,孔华,刘志昕. 2013

[3]A、B、J亚群禽白血病病毒混合感染的鉴定及gp85基因序列分析. 窦俊峰,汪最,李丽,卢琴,金鑫鑫,凌小淳,罗青平,翟新国. 2024

[4]海南地区番木瓜畸形花叶病毒的发现与鉴定. 杨勇,庹德财,沈文涛,言普,黎小瑛,周鹏. 2013

[5]西瓜PRSV-W和ZYMV-CH抗性的遗传与连锁分析. 马少芹,许勇,宫国义,张海英,沈火林. 2005

[6]MicroRNA用于创制抗PRSV番木瓜新种质的展望. 黄启星,张雨良,赵辉,孔华,曾会才,YunJ．Zhu,郭安平. 2012

[7]PRSV NIa-pro、NIa-vpg、NIb酵母双杂交诱饵表达载体的构建及自激活检测. 王明钦,沈文涛,周鹏. 2008

[8]接种PRSV番木瓜种苗胞质酵母双杂交cDNA文库的构建与分析. 沈文涛,周鹏. 2008

[9]四川成都地区复合侵染南瓜4种病毒的分子鉴定分析. 林晓敏,彭梅芳,范晓丽,陈克贵. 2021

[10]PRSV-CP基因小hpRNA植物表达载体的构建. 王树昌,言普,沈文涛,周鹏. 2009

[11]PRSV CP-VPg嵌合型ihpRNA干扰载体转化番木瓜的抗性分析. 王树昌,言普,沈文涛,周鹏. 2014

[12]数字PCR技术及其在检测领域的应用. 冯秀晶,易红梅,任星旭,任佳丽,葛建镕,王凤格. 2020

[13]水稻黑条矮缩病株不同分蘖内病毒含量分析. 王海涛,宛柏杰,董岩,王满,徐秋芳,周益军. 2021

[14]基于RT-PCR对低温沼气发酵过程中巴氏德醋杆菌的分析. 代金平,冯蕾,谢玉清,王志方,陈竞,王小武,周留艳,张慧涛,古丽·艾合买提,杨新平. 2022

[15]荧光定量PCR数据处理方法的探讨. 唐永凯,贾永义. 2008

[16]以梅花鹿P21基因为模板比较相对和绝对荧光定量PCR的准确性. 王大涛,郭倩倩,朱宏伟,刘振,王桂武,李春义. 2013

[17]数字PCR在转基因定量检测中的研究进展. 斯能武,李俊,武玉花,吴刚,张丽. 2021

[18]转基因小麦根际土壤镰刀菌Real-time QPCR方法的建立及应用. 王秀宇,林凡云,吴季荣,曹欢,史建荣. 2012

[19]HSA转基因水稻二重微滴数字PCR定量检测方法研究. 李晓飞,姚晓青,闫晓红,李俊,朱莉,吴刚,罗军玲. 2022

[20]生物炭协同暗管排水对滨海盐碱土壤微生物群落的影响. 田雨雨,李东伟,曲子良,荆锐,赵青青,周新国. 2024

作者其他论文 更多>>

微信小程序