穿心莲R2R3-MYB基因家族的鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李静宇

作者： 李静宇;孙铭阳;徐世强;孙伟;顾艳;梅瑜;王继华

作者机构：

关键词： 穿心莲;R2R3-MYB基因家族;非生物胁迫;穿心莲内酯;功能预测

期刊名称： 中国中药杂志

ISSN： 1001-5302

年卷期： 2022 年 01 期

页码： 72-84

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： R2R3-MYB是一类调控植物生长发育及次生代谢的重要转录因子。利用生物信息学手段从穿心莲全基因组中鉴定R2R3-MYB基因,分析其理化性质、染色体定位信息、基因结构和保守序列信息、系统进化信息及启动子区域的顺式作用元件。结合转录组测序技术和qRT-PCR分析其在非生物胁迫和激素诱导下的表达谱。结果表明,穿心莲R2R3-MYB基因家族含有73个成员,分为34个亚家族C1～C34,其中19个归类于已知的拟南芥亚家族;73个成员不均一的分布在穿心莲的21条染色体上;蛋白的长度为148～887 aa,其中有36个偏酸性和37个偏碱性R2R3-MYB蛋白;穿心莲R2R3-MYB的结构域、motifs和基因结构相对保守;基因上游启动子区域含有光、茉莉酸甲酯、脱落酸和干旱等多种胁迫和激素响应元件,表明穿心莲R2R3-MYB可能会受到环境胁迫和激素的诱导;结合转录差异表达谱和同一亚家族功能保守性,推测ApMYB13/21/35/67/73(S22)基因可能通过ABA依赖途径调控干旱胁迫,ApMYB20(S11)和ApMYB55(S2)可能参与穿心莲高温和UV-C胁迫,ApMYB5(S7)和ApMYB33(S20)可能通过调控MEP途径中的关键酶的表达,影响穿心莲内酯的积累。该研究为深入研究穿心莲R2R3-MYB基因家族的功能和选育高穿心莲内酯含量的品种提供理论参考。

分类号： S567.219

  • 相关文献

[1]穿心莲优良种质筛选研究. 陈元生,王振华,罗战勇,郭尚志,杜勤,陈伶俐,谭铭喜,李淑玲. 2006

[2]国内外穿心莲研究态势分析. 孙铭阳,徐世强,张闻婷,顾艳,梅瑜,李静宇,周芳,王继华. 2022

[3]引种不同来源穿心莲叶中穿心莲内酯及脱水穿心莲内酯积累分析. 王振华,杜勤,陈伶俐,陈元生,罗战勇,王纠. 2007

[4]UV-C处理穿心莲转录组分析及穿心莲内酯合成相关基因挖掘. 孙铭阳,徐世强,李静宇,顾艳,梅瑜,张闻婷,周芳,王继华. 2022

[5]利用大孔树脂同时制备穿心莲内酯和脱水穿心莲内酯. 吴娇,梅文莉,戴好富,彭明. 2009

[6]药用植物穿心莲离体培养技术及其应用研究进展. 陈东亮,钟楚,简少芬. 2024

[7]穿心莲TCP基因家族全基因组鉴定及非生物胁迫下的表达分析. 张龙,徐世强,李静宇,胡学博,顾艳,王继华. 2024

[8]穿心莲内酯增强庆大霉素对小鼠烧伤创面感染的防治研究. 王瑶,周薇,沈犁,华子瑜. 2020

[9]优质穿心莲GAP种植技术. 邱道寿,王泽清,白春华,陈元生,陈俊标,李淑玲,谭铭喜,张振臣. 2008

[10]穿心莲茉莉酸甲酯及非生物胁迫下Real-time PCR内参基因的筛选. 李静宇,孙铭阳,徐世强,梅瑜,顾艳,周芳,孙伟,王继华. 2022

[11]药用植物穿心莲研究进展. 周芳,孙铭阳,梅瑜,顾艳,徐世强,李静宇,蔡时可,王继华. 2021

[12]甲基磺酸乙酯对穿心莲种子成苗的影响. 周芳,梅瑜,顾艳,蔡时可,王继华. 2020

[13]外施茉莉酸甲酯对穿心莲耐盐性的影响. 温赛群,姜涛,温春秀,刘灵娣,田伟,谢晓亮. 2020

[14]漳浦县穿心莲产业发展状况分析. 杨有泉,林忠宁,陈国平. 2014

[15]不同密度穿心莲与玉米套种对产量的互作效应分析. 黄春东,周海宇,李兰青,周国列,龚玉萍,杨仕冠. 2014

[16]穿心莲高产高效施肥技术研究. 丁楠,李录久,姚殿立,高杰军,郭熙盛,刘学敏. 2008

[17]不同产区穿心莲的耐盐性比较. 温赛群,刘灵娣,田伟,姜涛,温春秀. 2022

[18]木薯间作套种穿心莲高效栽培技术. 李灿荣,曾文丹,谢向誉,严华兵. 2016

[19]11种除草剂对穿心莲安全性评价及田间杂草防除效果. 郭成林,马跃峰,王彦辉,覃建林,吴文松. 2015

[20]穿心莲分子生药学研究进展. 张龙,李静宇,徐世强,王继华. 2024

作者其他论文 更多>>

微信小程序