腰果CBF基因家族的鉴定及响应冷胁迫的表达模式
文献类型: 中文期刊
第一作者: 崔恒久
作者: 崔恒久;曾教科;李雯;黄海杰;彭世清;郭冬;蒲金基;周永凯;李辉亮
作者机构:
关键词: 腰果;低温响应;CBF转录因子;基因家族;qRT-PCR
期刊名称: 热带作物学报
ISSN: 1000-2561
年卷期: 2024 年 45 卷 003 期
页码: 473-480
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 腰果(Anacardium occidentalie Linn)属于典型的热带果树,主要在我国的云南省、海南省等地种植.腰果具有重要的经济价值、社会价值、生态价值,为农民增产创收,实现共同富裕和乡村振兴战略具有重要价值.腰果对于低温十分敏感,在 8℃时就会受到严重伤害,生长停止.所以低温胁迫是制约腰果生长的重要非生物胁迫.CBF 转录因子是植物在应对低温、干旱、盐等非生物胁迫下中发挥重要作用的转录因子.然而CBF基因家族在腰果中的作用尚未阐明,该家族在低温胁迫下的表达模式尚不清楚.本研究对腰果AoCBF基因家族的基本特性进行探究,通过生物信息学方法,在腰果转录组中鉴定并获得 6 个AoCBF基因家族成员,分别对其系统发育、理化性质、蛋白结构、低温诱导下表达模式和启动子作用元件进行分析.理化性质分析结果表明:6 个AoCBF蛋白长度为 189~334 aa,蛋白分子量为 21.31~37.89 kDa,等电点均小于 7,表明该蛋白呈酸性,且均包含AP2/ERF结构域.基序分析表明:AoCBF基因存在 5 个基序,不同AoCBF基因Motif的缺失暗示着相关功能的缺失性.系统发育树分析表明:6 个AoCBFs可分为A、B两个亚组,其中A组包含 1 个基因,B组仅包含 5 个基因.启动子顺势作用元件分析得出,AoCBF可能参与激素响应及非生物胁迫响应过程.荧光定量表达分析显示,AoCBFs对低温冷胁迫均有不同程度的响应,表明AoCBF在响应低温胁迫生物学过程中发挥着一定的作用.本研究分析了 AoCBF基因家族的基本特性,为后续AoCBF的深入研究和应用积累基础数据.
分类号: S667.9
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