‘岩溪晚芦’椪柑果皮与果肉差减cDNA文库的构建及初步分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 叶庆亮

作者： 叶庆亮;江东;彭爱红

作者机构：

关键词： 柑橘;抑制性差减杂交(SSH);cDNA文库;表达序列标签;克隆;差异表达基因

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2009 年 36 卷 07 期

页码： 967-974

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以‘岩溪晚芦’椪柑(Citrus reticulata Blanco)成熟果实果皮和果肉为材料,采用抑制性差减杂交技术成功构建了果皮(tester)与果肉(driver)的差减cDNA文库。结果显示:cDNA克隆外源插入片段大小介于100～500bp之间。成功对411个克隆进行了测序,测序结果经与NCBI基因库中序列进行比较,377个EST找到了同源序列,它们分属于126个基因,涉及到色素合成、能量代谢、初级代谢、次生代谢、抗逆防御、蛋白代谢、信号转导、香味形成、果皮软化(衰老)、精油合成、抗氧化等代谢途径和生理生化过程。还有一些基因涉及到三价铁螯合物、反转录转座子gag蛋白、查尔酮合成、硼离子转运、儿茶酚氧位甲基转移酶等功能。功能已知且没有重复的EST共有63个,占总数的49.2%。有5个基因共62个克隆虽在Blast搜索时找到了较高的同源性序列,但功能目前尚未明确。另有34个基因未搜索到同源序列,可能为新发现的基因。

分类号： S666

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