cDNA微阵列鉴定差异表达基因的可靠性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王冰林

作者： 王冰林;柳俊;李媛媛;谢从华

作者机构：

关键词： cDNA微阵列;差异表达基因;可靠性

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2008 年 23 卷 03 期

页码： 9-12

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 应用马铃薯晚疫病水平抗性相关的1 009条表达序列标签(ESTs)所制备的cDNA微阵列和荧光信号Cy3,Cy5杂交系统,通过同一样品RNA的自身比较试验及与不同样品RNA的差异分析试验,对该技术的重复性和可靠性进行了验证分析。结果表明,在自身比较试验中,芯片杂交的假阳性率仅为0.79%,相关系数高达0.981 1;在差异分析试验中,同向标记、正反向标记、同一芯片内2个重复杂交结果的相关系数分别为0.966 0,0.889 5,0.980 2。研究结果证实,cDNA芯片技术具有高度的可靠性,可以鉴定出显著差异表达基因,并构建高质量的基因表达数据库,通过3次生物学重复和2次技术重复试验(采用正、反向标记)即可克服绝大部分试验误差。

分类号： Q78

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