板栗PPO基因克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 程丽莉

作者： 程丽莉;程运河;兰彦平;曹庆昌;胡广隆;苏淑钗

作者机构：

关键词： 板栗;果实;PPO基因;生物信息学;表达分析

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2020 年 33 卷 007 期

页码： 1360-1365

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]研究PPO基因在栗仁受热褐变物质代谢中的生理功能.[方法]在对板栗果实转录组测序的基础上,获得1条PPO unigenes,克隆并对其进行生物信息学分析.[结果]克隆PPO基因完整开放阅读框1794 bp,命名为CmPPO,编码597个氨基酸,属于络氨酸酶基因家族蛋白,包含络氨酸普通中心区域和多酚氧化酶中间保守域.CmPPO编码的多酚氧化酶属于亲水性蛋白质,相对分子量66 335.38,理论等电点(pI)6.45,属于酸性蛋白,不存在跨膜区,不属于膜结合蛋白.CmPPO蛋白酶的二级结构α-螺旋比例21.22%,无规则卷曲59.13%,延伸主链15.91%,β-转角3.85%.三级空间结构模型分析与蔷薇科苹果络氨酸酶结构(MdPPO1)有72.75%的序列一致度,53%的序列相似度,氨基酸序列一致性达到68.43%,推测它们具有类似功能.通过qRT-PCR验证,CmPPO基因在板栗不同品种、果实不同组织中表达差异与果实褐变度不一致,在弱褐变品种中表达却最高.[结论]褐变不是单基因控制,而是多基因、多种代谢途径共同参与作用的结果.

分类号： S664.2

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