合作猪γ-IFN基因外显子4多态性分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 马小军

作者: 马小军;李娟娟;王立贤;罗玉柱;魏恒;张小丽;李小飞

作者机构:

关键词: 合作猪;γ-IFN基因;PCR-SSCP;多态性

期刊名称: 畜牧与兽医

ISSN: 0529-5130

年卷期: 2011 年 43 卷 12 期

页码: 24-27

收录情况: 北大核心

摘要: 为了研究合作猪γ-IFN基因的多态性,确定其等位基因数、核苷酸多态位点,各等位基因是否符合Hardy-Weinberg平衡状态、多态信息含量、有效等位基因数和杂合度,采用PCR-SSCP方法检测了138头合作猪γ-IFN基因外显子4的等位基因,并克隆、测序群体内变异产生的各等位基因序列,就基因型和等位基因单倍型序列数据开展分析。序列比对分析发现5个核苷酸多态位点,其中5 284 bp(A→G)、5 341 bp(G→A)、5 371 bp(A→G)为新发现突变位点。试验群体发现4种基因型AA、AB、AC和AD,其中A等位基因频率为0.963 8,为优势等位基因。经χ2适合性检验,该群体处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。γ-IFN基因遗传多态指数中,杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、有效等位基因数(Ne)均较低,表明合作猪γ-IFN基因比较保守。

分类号: S828

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