35份北方地区杨树种质资源的遗传多样性及种质指纹图谱的构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘巍

作者： 刘巍;张妍;彭儒胜;尹杰;杨冰

作者机构：

关键词： 杨树;种质资源;遗传多样性;指纹图谱;北方地区

期刊名称： 东北林业大学学报

ISSN： 1000-5382

年卷期： 2024 年 52 卷 010 期

页码： 19-26

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以辽宁省杨树研究所杨树(Populus L.)种质资源保存圃于2005年秋季采用1年生根桩苗方式栽植的(株行距4 m×8 m)35份北方地区常见的杨树种质为研究对象(黑杨派种质14份、黑杨派杂交种种质11份、青杨派杂交种种质9份、白杨派种质1份),2022年6月份采集大树嫩叶，采用十六烷基三甲基溴化铵法(CTAB)提取DNA;从已报道的杨树简单重复序列(SSR)引物序列中选取42对简单重复序列引物用于分析；选取7份不同类型种质材料进行引物筛选，选出18对扩增条带清晰、多态性丰富、稳定性强的简单重复序列引物，进行供试材料的聚合酶链式反应(PCR)扩增(95℃预变性5 min; 95℃变性30 s, 50℃退火30 s, 72℃延伸30 s, 35个循环；最后72℃延伸10 min; 4℃保存),采用ABI3730型基因分析仪对扩增片段进行毛细管电泳检测。采用DataFormater、POPGENE32软件进行数据转换并分析电泳结果，计算总位点数、多态位点数、期望杂合度、观测杂合度等遗传多样性指标；采用NTSYS 2.1软件中的简单匹配(SM)相似系数程序，计算任意两个品种间的相似系数；采用非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析；采用毛细管电泳荧光简单重复序列分子标记技术，分析35份杨树种质资源遗传多样性和遗传关系、构建35份杨树种质的简单重复序列指纹图谱，补充全国杨属分子基因库。结果表明：筛选出的18对简单重复序列引物，共检测到总位点数235个、多态位点比例为100%、每对引物检测到多态位点为6～18个(平均13.06个)、平均期望杂合度为0.799、平均观测杂合度为0.689、平均多态信息含量为0.769。18对引物，共扩增特异性位点70个、每对引物检测到特异性位点为1～9个(平均3.89个)、特异性比率为31.63%。非加权组平均法聚类分析表明，35份杨树种质资源遗传相似系数在0.753～0.979之间(平均0.814),具有较高的遗传相似性；当遗传相似系数在0.815时，参试样品可分为4个大类，第Ⅰ大类又可分为3个亚类，聚类分析结果与种质的系谱关系和表型特征分类基本吻合，能够较好地反映种质间的亲缘关系。通过引物GCPM-1255、PMGC-2525、ORPM-103、WPMS14构建35份杨树种质资源的简单重复序列指纹图谱，可将全部种质区分开。

分类号： S792.11

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