云南疣粒野生稻部分cDNA片段的分离和注释

文献类型： 中文期刊

第一作者： 史冬燕

作者： 史冬燕;程在全

作者机构：

关键词： 云南疣粒野生稻;cDNA文库;SMARTTM技术;序列同源性

期刊名称： 安徽大学学报(自然科学版)

ISSN： 1000-2162

年卷期： 2008 年 32 卷 03 期

页码： 89-92

收录情况： 北大核心

摘要： 从疣粒野生稻cDNA扩增文库中随机挑取500个噬菌斑,通过载体环化,选择120个菌样进行测序,获得的95条序列,分别采用Blast、ORFfinder、UniGene和EntrezGene系统等软件进行序列分析,结果为:与栽培稻日本晴序列比较匹配碱基数>400 bp的占27.37%;确定可阅读框(>100 bp,具有起始和终止密码子)的占90%;与拟南芥的功能基因比较,相似性大于60%的有46个;确定功能、代谢过程和编码蛋白部位的cDNA片段分别有34个、31个和31个.

分类号： S511.9

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