木薯钙/CaM调控类受体激酶基因MeCRLK1的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张帆

作者： 李瑞梅;袁帅;耿梦婷;姚远;刘姣;段瑞军;符少萍;胡新文;郭建春

作者机构：

关键词： 木薯钙;钙调素调控类受体激酶;基因克隆

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2017 年 04 期

页码： 1581-1587

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 木薯作为热带亚热带植物对低温非常敏感。为研究木薯对低温敏感的分子机制,我们从低温信号传导途径中的感知方面展开研究。植物类受体激酶作为信号传导途径中的信号接收器,在植物响应低温信号刺激过程中起重要作用。因此本研究利用RT-PCR从木薯栽培种SC8中克隆了一个钙/钙调素调控类受体激酶基因,命名为Me CRLK1(Gen Bank Accession No.KP256022)并进行了系统的生物信息学分析。研究结果表明该基因CDS区为1 296 bp,编码一个431 aa的蛋白。该蛋白的分子式为C_(2118)H_(3391)N_(605)O_(636)S_(18),分子量约为48.08 k D,理论等电点为8.11。该蛋白预测具有多个不同的磷酸化位点,3个Ca M结合位点,4个紊乱区和1个球蛋白区。蛋白结构分析表明该蛋白具有一个跨膜区,一个S_TKc结构域,N末端没有信号肽。预测此蛋白可能亚细胞定位于膜上。Me CRLK1和At CRLK1蛋白序列分析表明,它们的相似性为79.8%,序列一致性为77.6%。二者序列的差异主要位于C末端。该研究结果为进一步验证Me CRLK1基因的功能奠定了基础。

分类号： Q943.2`S533

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