ToLCNDV广东冬瓜分离物的分子特征及其遗传演化规律

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭孟泽

作者： 郭孟泽;张磊;孙平平;江彪;闫晋强;李正男

作者机构：

关键词： 新德里番茄曲叶病毒;冬瓜;全基因组序列;遗传多样性;谱系地理分析

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2025 年 58 卷 019 期

页码： 3890-3904

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]新德里番茄曲叶病毒(tomato leaf curl New Delhi virus,ToLCNDV)是近年来危害我国瓜类蔬菜最严重的病毒性病原之一.目前,有关中国流行株的基因组序列报道有限,且国内尚未报道ToLCNDV在冬瓜(Benincasa hispida)上的发生.本研究旨在明确ToLCNDV在广东冬瓜中流行规律,分析ToLCNDV中国分离物的序列特异性、致病性、遗传多样性以及时空迁移特征,为ToLCNDV的防控提供理论依据.[方法]通过高通量测序、PCR扩增技术对79份冬瓜样品进行ToLCNDV的检测和全基因组序列扩增,并进行系统发育、序列一致性、遗传多样性、贝叶斯系统发育及谱系地理分析.此外,通过汁液摩擦接种技术对12种ToLCNDV潜在寄主进行致病性验证.[结果]高通量测序结果表明,所采集冬瓜样品中存在ToLCNDV.PCR检测发现79份疑似病毒样本中58份感染了ToLCNDV,检出率高达73.4%;ToLCNDV冬瓜分离物可通过汁液摩擦接种侵染西瓜(Citrullus lanatus)、丝瓜(Luffa aegyptiaca)、西葫芦(Cucurbita pepo)、菜豆(Phaseolus vulgaris)、黄瓜(Cucumis sativus)、瓠瓜(Lagenaria siceraria)、克利夫兰烟(Nicotiana clevelandii)以及本氏烟(N.benthamiana)8种植物;ToLCNDV冬瓜分离物23GD_BeHi1 的DNA A片段核苷酸序列全长为2 739 bp,DNA B片段核苷酸序列全长为2 693 bp;序列一致性分析结果显示,ToLCNDV冬瓜分离物与国内已知的ToLCNDV分离物DNA A和DNA B完整序列一致性分别在98.7%—99.7%和98.7%—99.3%;系统发育分析显示,基于ToLCNDV中国分离物DNA A和DNA B序列所重建的系统发育树均被分为两个明显的分支,且本研究所获的分离物均在Clade I分支;ToLCNDV中国分离物之间不存在重组事件;遗传多样性分析结果显示,ToLCNDV中国分离物群体内部遗传多样性相对较低,群体大小保持稳定且未发现重组事件,但江苏和上海分离物之间存在显著遗传分化;贝叶斯系统发育分析结果显示,基于DNA A和DNA B数据集所构建的MCC树的根均为浙江分离物,推断ToLCNDV的出现时间分别为 2020 年 4 月 25 日和 2020 年 11 月 30 日;谱系地理分析结果显示,浙江是我国ToLCNDV的起源中心,在广东发生了种群扩张.[结论]获得了我国ToLCNDV冬瓜分离物的全基因组序列,其DNA A和DNA B片段核苷酸序列全长分别为 2 739 和 2 693 bp.通过摩擦接种证明其亦可侵染西葫芦、西瓜、丝瓜、黄瓜、菜豆、克利夫兰烟、瓠瓜以及本氏烟,并引起卷曲、褪绿等症状.

分类号： S436.429

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