牡丹ARF基因家族鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵银鸽

作者： 赵银鸽;袁欣;高杰;王慧娟;李艳敏;王晓晖;师曼;冯乃曦;符真珠;贾文庆

作者机构：

关键词： 牡丹;ARF基因家族;生物信息学;基因表达

期刊名称： 河南农业科学

ISSN： 1004-3268

年卷期： 2024 年 53 卷 011 期

页码： 117-126

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究牡丹生长素响应因子（Auxin response factor,ARF）家族基因，对其基因家族进行鉴定，并对其进行生物信息学分析。结果表明，在牡丹岛锦、凤丹、洛神晓春中共鉴定出19个ARF基因，以拟南芥ARF基因家族进化分类为依据，将牡丹ARF基因家族成员分为4个亚族，根据系统发育树发现，牡丹与拟南芥的ARF同源基因存在密切的进化关系。不同牡丹ARF蛋白长度、等电点存在差异。所有PsARF均含有保守的B3和Auxin＿resp结构域，大部分PsARF还含有Aux/IAA结构域。保守基序分析表明，Motif数目为4～12个；基因结构分析显示，牡丹ARF基因内含子数量为1～19个；不同亚族间的Motif和内含子数目有一定的差异。组织表达特性分析显示，除PsARF2b在各个组织中不表达外，所有PsARF基因在牡丹组培苗根、茎、叶中均有表达，但在不同组织中的表达量存在很大差异，如PsARF7、PsARF19、PsARF8a、PsARF8b、PsARF6、PsARF11a、PsARF11b、PsARF9、PsARF16b、PsARF17、PsARFx在根中的表达量最高，PsARF5、PsARF3、PsARF4在茎中的表达量最高，而PsARF2a、PsARF1、PsARF16a、PsARF10在叶中的表达量最高。

分类号： S685.11

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