伞形科13种植物CHS基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王堃

作者： 王堃;钟秀来;朱顺华;罗庆;张新圻;谭国飞

作者机构：

关键词： 查尔酮合成酶;伞形科;野生胡萝卜;生物信息学;系统进化树

期刊名称： 贵州农业科学

ISSN： 1001-3601

年卷期： 2025 年 53 卷 002 期

页码： 9-21

收录情况： 北大核心

摘要： 【目的】探明查尔酮合成酶（CHS）基因在伞形科不同植物中的结构特征，为了解类黄酮化合物在伞形科植物中的生物学功能及其综合利用提供参考。【方法】以伞形科六合黄心芹（Apium graveolens‘Liuhe Huangxinqin’）、津南实芹（A. graveolens‘Jinnan Shiqin’）、文图拉（A. graveolens‘Ventura’）、八卦洲水芹（Oenanthe javanica‘Baguazhou’）、溧阳白芹（O. javanica‘Liyang Baiqin’）、老山芹（Heracleum moellendorffii）、积雪草（Centella asiatica）、天胡荽（Hydrocotyle sibthorpioides）、白芷（Ammi majus）、茴香（Foeniculum vulgare）、明日叶（Angelica keiskei）、野生胡萝卜（Daucus carota）以及欧芹（Petroselinum crispum）13种植物为研究对象，通过NCBI数据库检索及基因克隆测序，比对所得各物种CHS基因序列及推导的氨基酸序列，并进行氨基酸理化性质、跨膜结构域、亚细胞定位预测及构建系统进化树等生物信息学分析。【结果】伞形科13种植物的CHS基因开放阅读框（ORF）全长在1 187～1 197 bp，编码395～398个氨基酸，CHS基因序列比对一致性为90.02%，所编码的氨基酸序列比对的一致性为93.51%;CHS蛋白均为亲水性蛋白，不含跨膜区域，亚细胞定位预测结果均定位于细胞质中。系统进化树显示，除野生胡萝卜DcCHS外，其余伞形科12种植物的CHS处于同一分枝上，其他相同科植物的CHS均能聚在一起。【结论】CHS蛋白在伞形科六合黄心芹、津南实芹等12种植物中具有较高保守性及稳定性，预测其可发挥类似的功能，而野生胡萝卜DcCHS在进化树中与伞形科植物距离较远，在功能上可能存在差异。

分类号： Q943.2

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