中间锦鸡儿WRKY12基因克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 万东莉

作者： 万东莉;张杰;王瑞刚;李国婧;万永青

作者机构：

关键词： 中间锦鸡儿(Caragana intermedia);WRKY12;基因克隆;生物信息学

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 01 期

页码： 100-108

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： WRKY转录因子是植物信号网络中不可缺少的部分,是最大的调节子家族之一。本研究从中间锦鸡儿干旱转录组及基因表达检测数据中,挑选出对干旱、冷、盐、碱及ABA都响应明显的CiWRKY12基因,对其进行克隆及生物信息学分析。结果显示:CiWRKY12基因的开放阅读框为696 bp,编码232个氨基酸,含有一个典型的WRKY保守结构域,属于GroupⅡc亚族。对转录因子CiWRKY12与其它8种植物的同源蛋白的理化性质和一、二、三级结构进行生物信息学比较分析,发现这9个蛋白无规则卷曲比例较高,大部分属于不稳定蛋白;亚细胞定位预测表明大部分的蛋白定位于细胞核内;多重序列比对显示WRKY保守结构域保守性很高,其三级结构上也呈现较高的相似性,推测这9个转录因子可能具有相似的转录调控功能。通过本研究生物信息学分析将有助于对CiWRKY12深层次功能研究提供借鉴作用。

分类号： S793.3

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