具有Ⅲ型分泌系统的Pseudomonas moraviensis FP1761植物益生功能及其全基因组分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 廖开吉
作者: 廖开吉;罗媛;夏振远;魏海雷;曾凯芳
作者机构:
关键词: 摩拉维亚假单胞菌;生物防治;植物益生菌;全基因组分析;Ⅲ型分泌系统
期刊名称: 植物病理学报
ISSN: 0412-0914
年卷期: 2020 年 006 期
页码:
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 本研究从节瓜根际分离到一株具有防病促生功能的荧光类假单胞菌FP1761.该菌株对部分植物病原真菌和细菌具有拮抗能力,能够解钾、解有机磷和无机磷,可产生氨、蛋白酶、嗜铁素、吲哚乙酸.生物测定表明菌株FP1761可显著促进小麦生长.生理生化、平均核苷酸相似度、16S rDNA和多基因分析将FP1761鉴定为摩拉维亚假单胞菌(Pseudomonas moraviensis).菌株FP1761基因组草图全长6.12 Mb,(G+C)含量为59.9%,共编码5467个基因序列.将该菌株与种内3个代表性菌株进行泛基因组和核心基因组分析,共产生4 357个共有基因,菌株FP1761特有基因327个.利用antiSMASH对菌株次生代谢基因簇进行预测,发现其含有8个潜在的次生代谢产物基因簇.其中两个基因簇与嗜铁素pyoverdine合成相关,未见聚酮类合成基因.基因组分析发现,该菌株具有与病原性假单胞菌相似的Ⅲ型分泌系统,但丢失了效应蛋白调控因子hrpS和转运相关的hrpH和hrpK1基因.对全基因组扫描,菌株FP1761仅保留了病原性假单胞菌的保守效应蛋白AvrE和HopAA1-1.FP1761是目前已发现的唯一具有Ⅲ型分泌系统的摩拉维亚假单胞菌.本研究表明摩拉维亚假单胞菌FP1761具有潜在的植物防病促生功能,但其Ⅲ型分泌系统与植物益生互作机制有待进一步解析.
分类号: S476.1
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