小麦EST数据批量分析平台的构建与应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 庞晓斌

作者： 庞晓斌;毛新国;景蕊莲;昌小平;李彦舫

作者机构：

关键词： 小麦;EST数据;批量分析;生物信息学;水分胁迫;cDNA

期刊名称： 麦类作物学报

ISSN： 1009-1041

年卷期： 2006 年 26 卷 03 期

页码： 146-151

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为进行EST数据批量分析,构建了EST/cDNA序列数据高通量、自动化分析平台。该平台基于Linux操作系统,主要由一些免费软件和perl程序构成,具有自动组装EST序列、查找同源基因、注释基因功能,同时具有进行基因分类等功能。利用该平台对小麦水分胁迫诱导表达的5个cDNA文库的6733条EST序列进行全面分析,初步建立了小麦水分胁迫诱导的基因表达谱。检测结果表明,小麦EST数据批量分析平台为批量EST序列的生物信息学分析提供了实用、便捷工具。

分类号： S512.1

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